40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1064 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1064  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  263  8e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.264456  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22900  hypothetical protein  45.04 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0379071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1561  membrane protein  41.35 
 
 
124 aa  97.1  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3212  hypothetical protein  40 
 
 
130 aa  95.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0878048  normal  0.0167489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2423  hypothetical protein  52.44 
 
 
128 aa  94.7  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0727149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3533  putative transmembrane protein  41.18 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.051598  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2978  putative transmembrane protein  39.71 
 
 
133 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.698485 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1271  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0708152  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10710  hypothetical protein  38.17 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00294922  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2656  hypothetical protein  38.52 
 
 
137 aa  84.3  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.45756  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12197  transmembrane protein  39.26 
 
 
134 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1560  membrane protein  41.35 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.354904  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5779  hypothetical protein  38.41 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000546753  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1097  hypothetical protein  38.35 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3328  putative transmembrane protein  39.01 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3277  putative transmembrane protein  39.01 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3266  putative transmembrane protein  39.01 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0883  hypothetical protein  38.73 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1648  hypothetical protein  35.34 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.453573 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13700  hypothetical protein  38.64 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.588168  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1583  hypothetical protein  43.61 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.228645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2857  hypothetical protein  34.48 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311607  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3027  hypothetical protein  37.41 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335195  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25060  hypothetical protein  38.04 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3456  membrane protein  36.25 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1394  hypothetical protein  36.97 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0233371  hitchhiker  0.00692723 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0997  hypothetical protein  33.08 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4921  hypothetical protein  37.08 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.028109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3276  putative transmembrane protein  38.55 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2939  hypothetical protein  32.2 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000333137  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1738  hypothetical protein  35.37 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00377862  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2590  hypothetical protein  33.7 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000130432  hitchhiker  0.00139285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3461  hypothetical protein  35.82 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3235  hypothetical protein  34.07 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00764978 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0682  hypothetical protein  35.63 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16020  hypothetical protein  32.22 
 
 
208 aa  47  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.283829  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3939  hypothetical protein  32.95 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.638034  normal  0.356234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5111  hypothetical protein  62.07 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435647  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1402  hypothetical protein  62.07 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174995  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3646  hypothetical protein  30.43 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000185355  normal  0.0296142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>