More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0703 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0703  peptidase M24  100 
 
 
517 aa  1039    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2481  peptidase M24  66.87 
 
 
517 aa  641    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739466 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0769  peptidase M24  70.8 
 
 
521 aa  654    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27810  Xaa-Pro aminopeptidase  69.26 
 
 
522 aa  693    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.517657  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2910  peptidase M24  65.57 
 
 
513 aa  632  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38821  normal  0.0334658 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2788  Xaa-Pro aminopeptidase  61.61 
 
 
530 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.364809  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2508  Xaa-Pro aminopeptidase  59.42 
 
 
531 aa  596  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000105082 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15300  Xaa-Pro aminopeptidase  61.11 
 
 
532 aa  591  1e-167  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0288526  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11300  Xaa-Pro aminopeptidase  59.88 
 
 
515 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.704744  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1161  Xaa-Pro aminopeptidase  58.22 
 
 
531 aa  561  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.398312  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0463  peptidase M24  56.72 
 
 
500 aa  549  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0543  peptidase M24  56.92 
 
 
500 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19260  Xaa-Pro aminopeptidase  56.06 
 
 
494 aa  533  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00637043  normal  0.0203425 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0216  aminopeptidase P  53.15 
 
 
531 aa  533  1e-150  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56198  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0463  peptidase, M24 family  50.68 
 
 
531 aa  512  1e-144  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1744  xaa-Pro aminopeptidase  51.93 
 
 
510 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0389057  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3497  Xaa-Pro aminopeptidase  50.1 
 
 
539 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.434008  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3026  hypothetical protein  48.9 
 
 
485 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371116  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1246  Xaa-Pro aminopeptidase  48.46 
 
 
627 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623221  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5913  Xaa-Pro aminopeptidase  48.97 
 
 
479 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.117741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2427  peptidase M24  49.49 
 
 
496 aa  425  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.362635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3048  peptidase M24  47.67 
 
 
501 aa  428  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.178755  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3284  Xaa-Pro aminopeptidase  48.21 
 
 
492 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.331819  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1364  Xaa-Pro aminopeptidase  47.37 
 
 
480 aa  420  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3058  Xaa-Pro aminopeptidase  50.21 
 
 
492 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.11104 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0669  Xaa-Pro aminopeptidase  46.09 
 
 
506 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.519514  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4713  Xaa-Pro aminopeptidase  41.29 
 
 
453 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1534  xaa-pro aminopeptidase  37.34 
 
 
441 aa  230  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000615425  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1782  peptidase M24  33.55 
 
 
461 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000518902  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2358  peptidase M24  34.8 
 
 
439 aa  224  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000327517  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2816  peptidase M24  32.75 
 
 
441 aa  223  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000333195  normal  0.738801 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  33.48 
 
 
443 aa  218  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  37.1 
 
 
446 aa  218  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  37.1 
 
 
446 aa  218  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0848  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain-containing protein  38.22 
 
 
442 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.283134  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  35.47 
 
 
445 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  35.87 
 
 
414 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  38 
 
 
442 aa  213  7.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  38.38 
 
 
446 aa  213  9e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1711  peptidase M24  32.61 
 
 
434 aa  213  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229951  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  35.27 
 
 
444 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  35.05 
 
 
443 aa  211  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  32.35 
 
 
439 aa  209  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1535  putative aminopeptidase P  31.97 
 
 
441 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.999654  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  35.08 
 
 
454 aa  207  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  33.97 
 
 
444 aa  207  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  34.62 
 
 
439 aa  207  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  35.12 
 
 
449 aa  206  7e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16321  putative aminopeptidase P  31.39 
 
 
441 aa  206  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  33.12 
 
 
444 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  33.55 
 
 
444 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6000  peptidase M24  34.55 
 
 
441 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  32.77 
 
 
436 aa  204  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  34.72 
 
 
437 aa  203  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  33.91 
 
 
436 aa  203  7e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  35.14 
 
 
441 aa  202  8e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  35.14 
 
 
441 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  35.21 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  35.14 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  35.14 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  35.14 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  35.14 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  34.29 
 
 
436 aa  201  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  35.14 
 
 
441 aa  201  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  35.21 
 
 
441 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0973  aminopeptidase P  34.16 
 
 
439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  33.62 
 
 
444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  33.41 
 
 
437 aa  200  6e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  34.74 
 
 
454 aa  199  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18411  putative aminopeptidase P  33.93 
 
 
439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.502832 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  35.71 
 
 
441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  33.4 
 
 
439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  35.57 
 
 
437 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  33.7 
 
 
436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  35.23 
 
 
438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16441  putative aminopeptidase P  30.09 
 
 
441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.689084  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  34.83 
 
 
443 aa  197  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  35.81 
 
 
441 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  35.01 
 
 
438 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16211  putative aminopeptidase P  30.95 
 
 
441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.878711  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  35.01 
 
 
438 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  32.2 
 
 
439 aa  197  5.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  33.97 
 
 
444 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  34.87 
 
 
438 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  33.12 
 
 
444 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  34.87 
 
 
438 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  34.19 
 
 
444 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  33.55 
 
 
461 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  33.76 
 
 
444 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  33.12 
 
 
444 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3287  aminopeptidase P  34.92 
 
 
439 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  34.63 
 
 
437 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  34.63 
 
 
437 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  34.63 
 
 
437 aa  194  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  33.55 
 
 
444 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2008  Xaa-Pro aminopeptidase  31.86 
 
 
427 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010826  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3277  peptidase M24  37.53 
 
 
442 aa  193  8e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.609187  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  35.04 
 
 
437 aa  192  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  34.89 
 
 
452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3362  peptidase M24  34.49 
 
 
439 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>