44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0075 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 197 aa  401  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.79 
 
 		 213 aa  88.6  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  28.09 
 
 		 206 aa  85.1  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  29.44 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  39.29 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  46.03 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  27.57 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  28.93 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  30.48 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  44.74 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  30.54 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  40.86 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  48.44 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  28.43 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  30.87 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  32.37 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  25.91 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  27.91 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  26.35 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  28.48 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  28.11 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  27.55 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  27.95 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1965  transcriptional regulator, ArsR family  44.23 
 
 		 102 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.891597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  29.86 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  23.49 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 137 aa  45.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1723  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 95 aa  45.1  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000132397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  45.16 
 
 		 195 aa  44.7  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1660  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0913425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  26.51 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3558  ArsR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 97 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681826  normal  0.406985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  22.35 
 
 		 201 aa  42  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2810  transcriptional regulator, ArsR family  35.82 
 
 		 229 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  34.78 
 
 		 120 aa  41.6  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>