18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3702 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3702  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  665    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0491552  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1360  protein of unknown function DUF1486  37.8 
 
 
345 aa  196  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.602593 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2241  hypothetical protein  37.62 
 
 
344 aa  192  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02563  hypothetical protein  34.36 
 
 
331 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0611  hypothetical protein  32.65 
 
 
338 aa  169  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1105  hypothetical protein  39.15 
 
 
319 aa  168  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2464  hypothetical protein  30.86 
 
 
338 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04814  hypothetical protein  33.11 
 
 
338 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2641  hypothetical protein  32.73 
 
 
332 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.0276572 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1417  protein of unknown function DUF1486  33.11 
 
 
174 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.289435  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2638  hypothetical protein  33.8 
 
 
174 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0108071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  39.22 
 
 
138 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  35.71 
 
 
137 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  32.94 
 
 
140 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  38.46 
 
 
141 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4712  protein of unknown function DUF1486  29.31 
 
 
139 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.719641 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3428  limonene-1,2-epoxide hydrolase  29.45 
 
 
139 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7231  protein of unknown function DUF1486  30.86 
 
 
149 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.390995  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>