51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1800 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1800  capsular polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 243 aa  495  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.6322  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0302  capsular polysaccharide biosynthesis protein  65.69 
 
 		 243 aa  311  6.999999999999999e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.04779  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0106  hypothetical protein  48.75 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105806 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2610  hypothetical protein  48.33 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4096  hypothetical protein  50.63 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541182 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3892  hypothetical protein  50.21 
 
 		 242 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1663  hypothetical protein  30.93 
 
 		 246 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0423  hypothetical protein  30.67 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0732  hypothetical protein  32.19 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  30.08 
 
 		 504 aa  106  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2595  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.2 
 
 		 494 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  33.88 
 
 		 241 aa  101  9e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  31.56 
 
 		 245 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  31.67 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  29.41 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0706  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  26.79 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0612  nucleotidyl transferase  27.23 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  28.39 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1806  putative nucleotidyltransferase  27.08 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.716393  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  27.54 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  26.56 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1996  hypothetical protein  22.89 
 
 		 548 aa  61.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0665457 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  25.42 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  24.68 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1064  nucleotidyl transferase  24.79 
 
 		 338 aa  58.9  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  25.11 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2751  hypothetical protein  24.42 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  22.92 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  23.04 
 
 		 325 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  24.31 
 
 		 325 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0729  Nucleotidyl transferase  24.05 
 
 		 332 aa  53.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2750  hypothetical protein  23.29 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0305  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  25.12 
 
 		 246 aa  52.4  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.297803  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  26.67 
 
 		 400 aa  52  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.94 
 
 		 349 aa  51.6  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14021  hypothetical protein  24.24 
 
 		 529 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  24.58 
 
 		 328 aa  48.9  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.62 
 
 		 325 aa  48.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1293  Nucleotidyl transferase  25 
 
 		 361 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.327446  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0077  nucleotidyl transferase  23.24 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.760983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0020  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.85 
 
 		 333 aa  46.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.583446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  20.74 
 
 		 326 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1181  nucleotidyl transferase  24.19 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0563368  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  21.94 
 
 		 354 aa  45.4  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  20.45 
 
 		 325 aa  45.4  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2596  dolichyl-phosphate mannose synthase  24.88 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  20.09 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4248  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  19.84 
 
 		 497 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602204  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4627  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  19.84 
 
 		 497 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.857379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4334  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  19.84 
 
 		 497 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699537  normal  0.383191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>