45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0615 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0615  predicted aconitase subunit 2  100 
 
 
142 aa  280  5.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478753  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1457  hypothetical protein  56.35 
 
 
146 aa  141  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.219192 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0800  aconitase subunit 2  57.14 
 
 
131 aa  135  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000377463 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1309  hypothetical protein  54.55 
 
 
132 aa  131  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0648242  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0718  hypothetical protein  54.33 
 
 
147 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1041  hypothetical protein  51.59 
 
 
138 aa  127  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0506  protein of unknown function DUF126  49.59 
 
 
130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1471  hypothetical protein  47.24 
 
 
137 aa  118  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0208  hypothetical protein  46.28 
 
 
137 aa  103  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.920123  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0709  hypothetical protein  44.88 
 
 
130 aa  96.7  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1754  hypothetical protein  44.88 
 
 
130 aa  96.7  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0149  hypothetical protein  46.72 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.104212  normal  0.0128163 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0019  hypothetical protein  44.26 
 
 
131 aa  95.5  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0452  hypothetical protein  42.62 
 
 
138 aa  94.7  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.265076  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0797  hypothetical protein  42.16 
 
 
136 aa  94  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  40 
 
 
576 aa  90.5  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0054  hypothetical protein  35.59 
 
 
128 aa  87.8  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  44.21 
 
 
563 aa  80.5  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3212  protein of unknown function DUF126  35.77 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0848  protein of unknown function DUF126  35.83 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6625  hypothetical protein  40 
 
 
154 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6392  hypothetical protein  40 
 
 
154 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1919  hypothetical protein  39.6 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6223  hypothetical protein  40 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  40.21 
 
 
580 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  41.3 
 
 
580 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  37.5 
 
 
580 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0854  hypothetical protein  35.65 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0009  hypothetical protein  36.36 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2555  hypothetical protein  32.85 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000224136  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1423  aconitase subunit 2  35.4 
 
 
166 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00470678  normal  0.0794476 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  36.56 
 
 
563 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1399  hypothetical protein  34.78 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.903911  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  37.35 
 
 
652 aa  64.7  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1865  hypothetical protein  40.43 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000298888  normal  0.822078 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2339  aconitase subunit 2  41.56 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3760  hypothetical protein  40.26 
 
 
159 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0710107  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3763  hypothetical protein  40.26 
 
 
159 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.177508 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4603  hypothetical protein  40.26 
 
 
159 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3637  hypothetical protein  37.66 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983078  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5491  hypothetical protein  37.66 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0950  aconitase subunit 2  27.88 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4970  hypothetical protein  29.13 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  35.94 
 
 
599 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4968  hypothetical protein  32.99 
 
 
158 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>