24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4934 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013746  Htur_4934  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  647    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216894  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3000  hypothetical protein  70.26 
 
 
309 aa  454  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3120  LtrC-like protein  70.03 
 
 
310 aa  455  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2839  hypothetical protein  69.93 
 
 
309 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3414  LtrC-like protein  64.72 
 
 
309 aa  426  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2970  LtrC-like protein  54.25 
 
 
313 aa  316  2e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5521  LtrC-like protein  30.35 
 
 
347 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466039  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3003  hypothetical protein  31.37 
 
 
282 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000551864  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0299  hypothetical protein  35.14 
 
 
271 aa  123  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0194  hypothetical protein  32.89 
 
 
514 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_241  LtrC-like protein  30.07 
 
 
502 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0567  hypothetical protein  33.91 
 
 
268 aa  106  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5283  hypothetical protein  28.15 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304344  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1070  hypothetical protein  31.91 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.767547  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0802  hypothetical protein  28.3 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.933435  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0111  hypothetical protein  25.74 
 
 
589 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.285938  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0077  hypothetical protein  23.91 
 
 
591 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0560  hypothetical protein  26.39 
 
 
471 aa  62.4  0.000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1109  hypothetical protein  26.6 
 
 
755 aa  62  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.941009  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3387  hypothetical protein  24.01 
 
 
334 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06570  protein of unknown function (DUF955)  25.91 
 
 
287 aa  56.2  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.96837 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00310  protein of unknown function (DUF955)  31.67 
 
 
263 aa  53.5  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1464  autotransporter beta-domain-containing protein  26.06 
 
 
731 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0611426  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1413  hypothetical protein  28.27 
 
 
293 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>