164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1747 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0029  SpoVR family protein  56.87 
 
 
692 aa  725    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0800461 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2234  stage V sporulation protein R-like protein  65.79 
 
 
680 aa  915    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.43304  normal  0.276408 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1747  SpoVR family protein  100 
 
 
675 aa  1382    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0409  stage V sporulation protein R-like protein  64.93 
 
 
672 aa  872    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.156049  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3370  SpoVR family protein  86.75 
 
 
679 aa  1170    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.390423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4653  SpoVR family protein  40.87 
 
 
499 aa  246  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.283151  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4172  SpoVR family protein  40.9 
 
 
500 aa  233  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3527  SpoVR family protein  38.44 
 
 
507 aa  230  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.103557  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2539  SpoVR family protein  38.18 
 
 
495 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.624214 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2992  SpoVR family protein  38.66 
 
 
513 aa  221  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1228  hypothetical protein  38.07 
 
 
499 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231331  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2637  SpoVR family protein  38.24 
 
 
499 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0820118  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2731  SpoVR family protein  38.24 
 
 
499 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.792518  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2208  SpoVR family protein  38.31 
 
 
775 aa  198  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1381  SpoVR family protein  34.68 
 
 
898 aa  188  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1819  SpoVR family protein  34.02 
 
 
467 aa  185  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0947722  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2004  SpoVR family protein  32.37 
 
 
470 aa  171  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0857  stage V sporulation protein R  32.37 
 
 
470 aa  170  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000642993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0853  stage V sporulation protein R  31.61 
 
 
470 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258518  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0822  stage V sporulation protein R  31.21 
 
 
472 aa  169  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0551  SpoVR family protein  32.18 
 
 
475 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795721  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1395  SpoVR family protein  32.58 
 
 
473 aa  168  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0680  SpoVR family protein  30.75 
 
 
471 aa  165  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4512  stage V sporulation protein R  30.75 
 
 
471 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105304 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0491  SpoVR family protein  31.75 
 
 
462 aa  163  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.488778  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0646  SpoVR family protein  30.64 
 
 
470 aa  160  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0680  stage V sporulation protein R  29.94 
 
 
472 aa  158  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0668  stage V sporulation protein R  29.94 
 
 
472 aa  158  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0731  stage V sporulation protein R  29.94 
 
 
472 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0767  stage V sporulation protein R  29.94 
 
 
472 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0929  stage V sporulation protein R  30.14 
 
 
472 aa  157  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1158  SpoVR family protein  31.64 
 
 
485 aa  153  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913818  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1539  stage V sporulation protein R  31.16 
 
 
449 aa  147  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0512  hypothetical protein  31.21 
 
 
466 aa  146  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1332  stage V sporulation protein R  31.16 
 
 
449 aa  146  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0448775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3004  SpoVR family protein  32.05 
 
 
459 aa  146  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1203  hypothetical protein  29.57 
 
 
462 aa  143  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2507  stage V sporulation-like protein, SpoVR  29.43 
 
 
478 aa  140  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0838  stage V sporulation protein R  30.58 
 
 
269 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08767e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0832  stage V sporulation protein R  30.14 
 
 
269 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000211556  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0201  SpoVR family protein  28.91 
 
 
532 aa  136  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262543 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1708  SpoVR family protein  29.77 
 
 
515 aa  134  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0816979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2329  SpoVR family protein  29.15 
 
 
542 aa  130  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.851956  normal  0.900002 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2858  SpoVR family protein  28.65 
 
 
507 aa  130  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2727  SpoVR family protein  28.65 
 
 
507 aa  130  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003983  hypothetical protein  28.41 
 
 
519 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2569  SpoVR family protein  31.12 
 
 
517 aa  128  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0246298  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0453  SpoVR family protein  29.11 
 
 
423 aa  128  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01539  SpoVR family protein  28.12 
 
 
519 aa  128  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1998  SpoVR family protein  27.84 
 
 
511 aa  127  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.154757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2108  SpoVR family protein  27.84 
 
 
511 aa  127  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342881  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2385  SpoVR family protein  28.89 
 
 
522 aa  126  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2362  SpoVR family protein  27.84 
 
 
511 aa  126  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  0.544957 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0545  SpoVR like family protein  29.02 
 
 
520 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4633  SpoVR family protein  29.02 
 
 
520 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.217683 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2206  SpoVR family protein  27.46 
 
 
505 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193374  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1465  SpoVR family protein  27.73 
 
 
516 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2747  SpoVR family protein  27.08 
 
 
511 aa  126  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00597319  decreased coverage  0.0000564649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1942  SpoVR family protein  27.78 
 
 
510 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5141  SpoVR family protein  29.8 
 
 
523 aa  125  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2159  SpoVR family protein  28.74 
 
 
520 aa  125  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.223118  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1946  SpoVR family protein  27.78 
 
 
510 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43581  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1329  SpoVR family protein  27.78 
 
 
510 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000362879  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1514  SpoVR family protein  27.78 
 
 
510 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4019  SpoVR family protein  29.51 
 
 
521 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4807  SpoVR family protein  30.84 
 
 
522 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.091895  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2002  SpoVR family protein  27.78 
 
 
510 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0731  SpoVR family protein  28.32 
 
 
515 aa  124  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1923  SpoVR family protein  28.53 
 
 
507 aa  124  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000604699  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1234  SpoVR family protein  27.52 
 
 
509 aa  123  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1740  SpoVR family protein  28.29 
 
 
502 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0137532  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2048  SpoVR family protein  28.29 
 
 
502 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0996469  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0395  SpoVR family protein  30.26 
 
 
522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466906  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3058  SpoVR family protein  28.7 
 
 
519 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2364  SpoVR family protein  27.65 
 
 
510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0656278  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2706  SpoVR family protein  27.5 
 
 
507 aa  122  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0429  SpoVR family protein  30.26 
 
 
522 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00886666  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01163  hypothetical protein  27.35 
 
 
510 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2460  SpoVR family protein  27.35 
 
 
510 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1675  SpoVR family protein  27.35 
 
 
510 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000834062  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1569  SpoVR family protein  28.24 
 
 
508 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00678887  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01173  hypothetical protein  27.35 
 
 
510 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000266726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1291  SpoVR family protein  27.35 
 
 
510 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1333  SpoVR family protein  27.35 
 
 
510 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000395748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2437  SpoVR family protein  27.35 
 
 
510 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00512702  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1961  SpoVR family protein  27.35 
 
 
510 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00693869  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2884  SpoVR family protein  27.95 
 
 
508 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1960  SpoVR family protein  27.84 
 
 
504 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2156  SpoVR family protein  28.16 
 
 
508 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0915233  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2004  SpoVR family protein  27.35 
 
 
511 aa  120  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000607664  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02753  SpoVR family protein  26.76 
 
 
515 aa  120  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1636  SpoVR family protein  27.95 
 
 
508 aa  120  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115572  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1684  SpoVR family protein  27.78 
 
 
505 aa  120  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000208668  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2506  SpoVR family protein  28.24 
 
 
508 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000176707  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1644  SpoVR family protein  27.95 
 
 
508 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000992283  hitchhiker  0.0074183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0426  SpoVR family protein  29.97 
 
 
522 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.375889  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3555  SpoVR family protein  28.2 
 
 
517 aa  120  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1779  SpoVR family protein  28.12 
 
 
508 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000504423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1772  SpoVR family protein  28.12 
 
 
508 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1816  SpoVR family protein  28.12 
 
 
508 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00125161  normal  0.518687 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>