25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_07440 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_07440  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 
381 aa  762    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.11 
 
 
1181 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  32.71 
 
 
1328 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.12 
 
 
1343 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  23.61 
 
 
1094 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  22.99 
 
 
320 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.71 
 
 
510 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  24.31 
 
 
1148 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  26.11 
 
 
644 aa  50.4  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  21.58 
 
 
959 aa  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  35.29 
 
 
402 aa  48.9  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  25.45 
 
 
958 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.35 
 
 
377 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  23.08 
 
 
501 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.5 
 
 
325 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.11 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  34.48 
 
 
1133 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  31.78 
 
 
1224 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  21.56 
 
 
524 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  29.2 
 
 
431 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  34.34 
 
 
381 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.48 
 
 
285 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1489  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.33 
 
 
374 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.451629  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.55 
 
 
821 aa  42.7  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1518  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.33 
 
 
374 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>