32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1079 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1079  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  100 
 
 
251 aa  497  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188621  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6408  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.47 
 
 
263 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.885579 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  27.4 
 
 
266 aa  52  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25.82 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.43 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.09 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  25.24 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  26.7 
 
 
266 aa  47  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  25.98 
 
 
263 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  27.73 
 
 
259 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.52 
 
 
262 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2032  hypothetical protein  27.37 
 
 
300 aa  45.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.48523  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  25 
 
 
259 aa  45.4  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  25.89 
 
 
297 aa  44.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  27.31 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.67 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  25.89 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  25.89 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.92 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1967  PhzF family phenazine biosynthesis protein  26.87 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  28.05 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.12 
 
 
259 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1138  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.39 
 
 
288 aa  43.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144521  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2046  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.55 
 
 
301 aa  43.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00628004  normal  0.447072 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1108  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.6 
 
 
287 aa  43.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  25.89 
 
 
297 aa  42.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  26.32 
 
 
275 aa  42.7  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  25.89 
 
 
297 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  26.04 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  25.89 
 
 
297 aa  42.7  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2053  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  29.88 
 
 
227 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1662  phenazine biosynthesis protein PhzF family  25.66 
 
 
278 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>