19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0609 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0609  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 454 aa  941    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0497  protein of unknown function DUF955  38.74 
 
 		 475 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000656756  hitchhiker  0.00190239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0749  appr-1-p processing domain-containing protein  35.03 
 
 		 156 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2930  Appr-1-p processing domain protein  40.88 
 
 		 168 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00352819  hitchhiker  0.00887383 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2091  Appr-1-p processing domain protein  37.01 
 
 		 154 aa  95.1  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2476  Appr-1-p processing domain protein  28.48 
 
 		 161 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370869 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2929  protein of unknown function DUF955  28.4 
 
 		 235 aa  51.2  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  31.61 
 
 		 156 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2309  hypothetical protein  28.32 
 
 		 241 aa  47.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.316951 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  30.99 
 
 		 349 aa  47.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  30.87 
 
 		 163 aa  46.6  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  35.71 
 
 		 174 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  37.04 
 
 		 302 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0960  Appr-1-p processing  23.74 
 
 		 179 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  26.92 
 
 		 294 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  31.63 
 
 		 277 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  25.95 
 
 		 158 aa  44.3  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  28.21 
 
 		 294 aa  43.9  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  27.59 
 
 		 289 aa  43.1  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>