43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2274 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2274  Fertility inhibition FinO-like protein  100 
 
 		 260 aa  520  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1782  putative solute/DNA competence effector  32.4 
 
 		 237 aa  72  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0742372  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2664  putative solute/DNA competence effector  32.4 
 
 		 237 aa  72  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764643  normal  0.0215757 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1671  putative solute/DNA competence effector  32.4 
 
 		 237 aa  72  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000024891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1811  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  30.57 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.179036  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1844  putative solute/DNA competence effector  28.65 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.790888  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2401  putative solute/DNA competence effector  30.35 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1469  putative solute/DNA competence effector  29.35 
 
 		 228 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00111252  normal  0.239206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1285  putative solute/DNA competence effector  29.35 
 
 		 228 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000538186  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1989  putative solute/DNA competence effector  29.35 
 
 		 228 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00261686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2047  putative solute/DNA competence effector  29.35 
 
 		 228 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.24524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2140  putative solute/DNA competence effector  28.24 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2099  putative solute/DNA competence effector  31.09 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000516503  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1985  putative solute/DNA competence effector  28.86 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000228326  hitchhiker  0.0069158 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1852  putative solute/DNA competence effector  29.17 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106932  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1543  putative solute/DNA competence effector  33.77 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01790  hypothetical protein  30.57 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01802  putative solute/DNA competence effector  30.57 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1801  putative solute/DNA competence effector  30.57 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.304179  normal  0.0872497 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1922  putative solute/DNA competence effector  30.57 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.31825e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1356  putative solute/DNA competence effector  30.57 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000120043  normal  0.2491 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2564  putative solute/DNA competence effector  30.57 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000584376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2060  putative solute/DNA competence effector  30.57 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2118  putative solute/DNA competence effector  30.77 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00110468  hitchhiker  0.0000659128 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1105  putative solute/DNA competence effector  33.02 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000947436  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02347  putative solute/DNA competence effector  32.08 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003430  ProQ protein  32.08 
 
 		 208 aa  53.1  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000470709  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1492  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  28.7 
 
 		 222 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1584  putative solute/DNA competence effector  29.45 
 
 		 219 aa  49.3  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1070  putative solute/DNA competence effector  29.8 
 
 		 211 aa  48.9  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.265506  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1992  putative solute/DNA competence effector  27.54 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025199  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0754  ProP effector  26.53 
 
 		 119 aa  47  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2203  putative solute/DNA competence effector  27.08 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.702868  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02001  putative solute/DNA competence effector  28.42 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101702  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2602  putative solute/DNA competence effector  28.3 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2811  putative solute/DNA competence effector  30 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00532714  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2441  putative solute/DNA competence effector  30.11 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.254744  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2448  putative solute/DNA competence effector  30.11 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1903  putative solute/DNA competence effector  30.11 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0351843  normal  0.135941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2484  putative solute/DNA competence effector  30.11 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000695377  normal  0.223616 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0133  hypothetical protein  28.23 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1747  putative solute/DNA competence effector  29.03 
 
 		 214 aa  42  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.144322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1672  putative solute/DNA competence effector  29.03 
 
 		 214 aa  42  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000366609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>