39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1289 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1289  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 135 aa  270  7e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2982  hypothetical protein  30.16 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.438088  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3180  type IV pilus assembly PilZ  30.16 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0971521  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3884  hypothetical protein  32.81 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3079  type IV pilus assembly PilZ  30.16 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623121  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2133  hypothetical protein  31.58 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2804  type IV pilus assembly PilZ  31.4 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0590  type IV pilus assembly PilZ  30.47 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040025  unclonable  1.11393e-18 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2813  type IV pilus assembly PilZ  27.73 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0982  hypothetical protein  29.41 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1011  type IV pilus assembly PilZ  30.33 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2110  type IV pilus assembly PilZ  34.68 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.623877 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0609  type IV pilus assembly PilZ  29.1 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3368  type IV pilus assembly PilZ  26.89 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.967691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0757  type IV pilus assembly PilZ  27.13 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1046  type IV pilus assembly PilZ  26.05 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.314079  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1050  type IV pilus assembly PilZ  25.21 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1111  type IV pilus assembly PilZ  25.21 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4049  hypothetical protein  30.65 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2945  type IV pilus assembly PilZ  27.35 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3535  type IV pilus assembly PilZ  25.21 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0228  hypothetical protein  27.73 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0837  type IV pilus assembly PilZ  25.41 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.699078  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1149  type IV pilus assembly PilZ  27.05 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.189898 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3156  type IV pilus assembly PilZ  27.5 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3218  type IV pilus assembly PilZ  27.05 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3357  type IV pilus assembly PilZ  27.05 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.91457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4884  hypothetical protein  25.98 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2523  hypothetical protein  25.4 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000798517  normal  0.122519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1227  hypothetical protein  24.62 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3218  type IV pilus assembly PilZ  27.05 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0656  putative signaling protein  27.05 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1036  type IV pilus assembly PilZ  26.89 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4639  hypothetical protein  23.26 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1417  hypothetical protein  28.12 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004403  hypothetical protein  26.05 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.364694  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3285  type IV pilus assembly PilZ  28.03 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000151513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0408  hypothetical protein  23.2 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.528155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2769  type IV pilus assembly PilZ  26.67 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00260561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>