18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2890 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2890  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
551 aa  1095    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31669  normal  0.842026 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3400  exonuclease of the beta-lactamase fold class-like protein  43.9 
 
 
791 aa  340  5e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4186  beta-lactamase domain protein  35.35 
 
 
545 aa  314  2.9999999999999996e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 
464 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4103  beta-lactamase-like  30.43 
 
 
539 aa  54.3  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 
460 aa  50.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2131  beta-lactamase domain protein  23.19 
 
 
464 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1028  beta-lactamase domain-containing protein  25.42 
 
 
616 aa  50.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  24.94 
 
 
602 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  30.7 
 
 
422 aa  48.9  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1883  beta-lactamase domain protein  24.87 
 
 
456 aa  48.5  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.19 
 
 
410 aa  47  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3425  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.9 
 
 
451 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  25.53 
 
 
821 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  24.93 
 
 
476 aa  45.8  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 
667 aa  45.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  32.81 
 
 
254 aa  43.5  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  25.31 
 
 
485 aa  43.5  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>