15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0667 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0667  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  100 
 
 		 255 aa  511  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.286513 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1668  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  64.46 
 
 		 251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1686  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  58.4 
 
 		 258 aa  279  3e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3614  hypothetical protein  59.44 
 
 		 258 aa  274  8e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2506  DNA topoisomerase I  53.66 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  32.87 
 
 		 747 aa  53.5  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  30.65 
 
 		 812 aa  52  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  31.45 
 
 		 817 aa  50.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  32.26 
 
 		 853 aa  48.5  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  29.22 
 
 		 814 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  29.22 
 
 		 814 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  30.23 
 
 		 837 aa  43.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  25.42 
 
 		 855 aa  42.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  52.94 
 
 		 931 aa  42.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  32.89 
 
 		 864 aa  42  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>