15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0054 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0044  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0049  tRNA-Leu  93.06 
 
 		 84 bp  103  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.256448  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0014  tRNA-Leu  89.29 
 
 		 83 bp  87.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0017  tRNA-Leu  88.24 
 
 		 85 bp  81.8  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.778206  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0046  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0046  tRNA-Leu  89.83 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.26124 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0019  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0037  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0027  tRNA-Leu  83.53 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0021  tRNA-Leu  86.27 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0040  tRNA-Leu  86.27 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.425514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0009  tRNA-Leu  86.27 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0011  tRNA-Leu  85.19 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000743607  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0036  tRNA-Leu  86 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.872291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>