13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3542 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3542  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  275  1e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3020  hypothetical protein  53.33 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2993  hypothetical protein  32.09 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1870  hypothetical protein  41.74 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0355867 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4303  Protein of unknown function DUF2078, membrane  38.68 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3030  hypothetical protein  46.38 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2725  hypothetical protein  39.51 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.057147  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  37.08 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0768  hypothetical protein  36.84 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.653371  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  42.86 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1136  hypothetical protein  51.28 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.516592  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  32.98 
 
 		 121 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>