23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3414 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3414  LtrC-like protein  100 
 
 		 309 aa  639    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2839  hypothetical protein  73.7 
 
 		 309 aa  481  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3000  hypothetical protein  73.7 
 
 		 309 aa  482  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3120  LtrC-like protein  68.3 
 
 		 310 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4934  hypothetical protein  64.72 
 
 		 310 aa  426  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216894  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2970  LtrC-like protein  53.8 
 
 		 313 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0299  hypothetical protein  35.44 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_241  LtrC-like protein  36.75 
 
 		 502 aa  126  5e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0194  hypothetical protein  34.59 
 
 		 514 aa  123  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5521  LtrC-like protein  31.89 
 
 		 347 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3003  hypothetical protein  30.84 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000551864  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0567  hypothetical protein  34.68 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5283  hypothetical protein  30.1 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304344  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1070  hypothetical protein  34.3 
 
 		 252 aa  89.4  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.767547  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0802  hypothetical protein  32.04 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.933435  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0111  hypothetical protein  27.68 
 
 		 589 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.285938  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3387  hypothetical protein  25.23 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0077  hypothetical protein  26.6 
 
 		 591 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1109  hypothetical protein  27.93 
 
 		 755 aa  65.1  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.941009  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0560  hypothetical protein  24.35 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00310  protein of unknown function (DUF955)  30.11 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06570  protein of unknown function (DUF955)  25.91 
 
 		 287 aa  57  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.96837 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1009  hypothetical protein  28.1 
 
 		 436 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000000366199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>