27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1957 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1957  OsmC family protein  100 
 
 		 201 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.226046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  27.75 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  24.73 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  30.08 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  29.55 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  33.65 
 
 		 147 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  29.55 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  29.55 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  31.18 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  32.04 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  28.71 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  30.67 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  34 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  30.28 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  28.36 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  28.36 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  35.16 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  27.66 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  29.58 
 
 		 182 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  34.62 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  27.41 
 
 		 156 aa  42.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  22.36 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  42.86 
 
 		 187 aa  41.6  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  22.33 
 
 		 180 aa  42  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  28.69 
 
 		 144 aa  41.6  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  23.26 
 
 		 187 aa  41.6  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  29.41 
 
 		 186 aa  41.6  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>