39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1065 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1065  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
369 aa  749    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.912454 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3593  hypothetical protein  94.58 
 
 
332 aa  633  1e-180  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3516  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
367 aa  56.2  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
370 aa  54.7  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 
705 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
394 aa  53.9  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 
370 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0825  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
434 aa  50.4  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
350 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  24.38 
 
 
394 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 
385 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2778  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
388 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457571  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2792  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
388 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2748  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
388 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5198  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
426 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.603506  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  24.47 
 
 
366 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3310  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
368 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
377 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  22.56 
 
 
396 aa  46.6  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3033  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
368 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125228  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06150  glycosyltransferase  27.23 
 
 
382 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369332  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  23.13 
 
 
364 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.26 
 
 
411 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  23.61 
 
 
412 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  25.26 
 
 
411 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
357 aa  44.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
445 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  32.33 
 
 
398 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1593  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
403 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
403 aa  43.5  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
399 aa  43.5  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
369 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 
409 aa  42.7  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  32.08 
 
 
402 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>