39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0257 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0257  protein of unknown function DUF192  100 
 
 		 122 aa  241  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.249837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0026  protein of unknown function DUF192  54.76 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2427  protein of unknown function DUF192  52.1 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0913366  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2491  protein of unknown function DUF192  50 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0477  protein of unknown function DUF192  47.97 
 
 		 122 aa  107  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2050  hypothetical protein  46.15 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000014639  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1679  hypothetical protein  37.61 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000505781 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2350  protein of unknown function DUF192  32.69 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1277  hypothetical protein  35.78 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2299  protein of unknown function DUF192  32.69 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0760  protein of unknown function DUF192  37.74 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0735  hypothetical protein  33.63 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000467927 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1732  hypothetical protein  33.66 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0106  hypothetical protein  31.13 
 
 		 174 aa  47.4  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1923  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0916  hypothetical protein  31.67 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1405  hypothetical protein  29.91 
 
 		 175 aa  45.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.542001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0921  protein of unknown function DUF192  26.62 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3009  hypothetical protein  33.64 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.538486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2294  hypothetical protein  32.63 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2735  hypothetical protein  32.69 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.331839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3213  protein of unknown function DUF192  31.53 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  0.317826 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03419  Exported protein  27.88 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.220309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0382  hypothetical protein  34.91 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.562846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0934  protein of unknown function DUF192  28.7 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2556  hypothetical protein  31.07 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.601199  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5719  hypothetical protein  27.88 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4616  hypothetical protein  30.28 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0550  protein of unknown function DUF192  31.73 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3197  protein of unknown function DUF192  31.13 
 
 		 169 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  36 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0031  hypothetical protein  26.26 
 
 		 188 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1123  hypothetical protein  37.74 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000335082  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2937  hypothetical protein  25.2 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1161  hypothetical protein  37.74 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119321  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1745  protein of unknown function DUF192  32.43 
 
 		 162 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1881  protein of unknown function DUF192  33.96 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1046  protein of unknown function DUF192  32.11 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3233  protein of unknown function DUF192  30.19 
 
 		 176 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.455449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>