27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1540 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1540  HPr kinase  100 
 
 
304 aa  622  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2549  HPr kinase  54.33 
 
 
303 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0304295 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2497  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  51.77 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0708  HPr kinase  47.04 
 
 
305 aa  259  4e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0102  HPr kinase  44.48 
 
 
301 aa  241  9e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263394  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1211  HPr kinase  39.51 
 
 
303 aa  222  6e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3100  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  39.25 
 
 
293 aa  203  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325175  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0594  HPr kinase  38.31 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.276169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2445  HPr kinase  36.78 
 
 
313 aa  182  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00295018  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1428  hypothetical protein  35.23 
 
 
285 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01318  HPr kinase  36.73 
 
 
203 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.362805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3572  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  31.56 
 
 
288 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1373  HPr kinase  28.73 
 
 
330 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401214  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0056  HPr kinase  36.71 
 
 
301 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0215  HPr kinase  30.11 
 
 
366 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.623305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3012  HPr kinase  24.87 
 
 
398 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26991  hypothetical protein  46.67 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4105  hypothetical protein  26.9 
 
 
404 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0872  HPr kinase  41.27 
 
 
347 aa  49.3  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2816  HPr kinase  33.06 
 
 
292 aa  49.3  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1478  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  39.34 
 
 
330 aa  46.2  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  47.83 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1280  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  39.29 
 
 
323 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3276  HPr kinase  32.32 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1585  HPr kinase  29.13 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4549  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  30.43 
 
 
323 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.123281 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1352  hypothetical protein  41.51 
 
 
268 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>