105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0063 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0063  FMN-binding domain-containing protein  100 
 
 
230 aa  463  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.650559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14330  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.06 
 
 
186 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000378736  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1958  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.03 
 
 
193 aa  87  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.537285  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  31.98 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0287  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.27 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0817829  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3196  RnfA-Nqr electron transport subunit  31.2 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.401599  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1531  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.46 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00374795  normal  0.943593 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1735  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.12 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  29.1 
 
 
201 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1240  FMN-binding domain protein  23.04 
 
 
192 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2021  electron transport complex protein RnfG  28.64 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2404  electron transport complex protein RnfG  27.27 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.59015  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1382  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.15 
 
 
190 aa  56.6  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000652446  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1157  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.35 
 
 
181 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1707  electron transport complex protein RnfG  32.64 
 
 
206 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.116117  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1568  electron transport complex protein RnfG  31.61 
 
 
206 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172689  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2010  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.64 
 
 
206 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00233582  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1839  electron transport complex protein RnfG  32.64 
 
 
206 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00239547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1820  electron transport complex protein RnfG  32.64 
 
 
206 aa  55.8  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.953623  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01601  electron transport complex protein RnfG  31.61 
 
 
206 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00338935  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.42 
 
 
344 aa  55.8  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1998  electron transport complex protein RnfG  31.61 
 
 
206 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0210205  normal  0.220533 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01591  hypothetical protein  31.61 
 
 
206 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00493917  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1817  electron transport complex protein RnfG  32.5 
 
 
206 aa  55.5  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0386367  decreased coverage  0.000324023 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0734  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.23 
 
 
211 aa  55.1  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2343  electron transport complex protein RnfG  32.12 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100314  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0520  FMN-binding domain-containing protein  26.39 
 
 
191 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.273649 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1625  electron transport complex protein RnfG  30.35 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.469993 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1312  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.46 
 
 
181 aa  53.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.777604  normal  0.23386 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1565  electron transport complex protein RnfG  30.35 
 
 
206 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  normal  0.099042 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1719  electron transport complex protein RnfG  30.35 
 
 
206 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1887  electron transport complex protein RnfG  30.35 
 
 
206 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.9 
 
 
200 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1553  electron transport complex protein RnfG  29.85 
 
 
206 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0583  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.15 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0722  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.74 
 
 
224 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271576  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  29.08 
 
 
185 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0986  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.11 
 
 
181 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625397  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3493  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  36.04 
 
 
268 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0530  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.14 
 
 
196 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1171  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.97 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3683  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  35.14 
 
 
268 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.448875  normal  0.0381019 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3935  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.65 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00699897  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1094  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.74 
 
 
200 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0750  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.86 
 
 
264 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3209  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.58 
 
 
255 aa  49.7  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0626162  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3196  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.71 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3376  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.86 
 
 
264 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1636  hypothetical protein  29 
 
 
213 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0756  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  35.14 
 
 
268 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.203828  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3562  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  34.23 
 
 
268 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002945  electron transport complex protein RnfG  31.09 
 
 
210 aa  48.5  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2897  electron transport complex, G subunit  27.23 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3270  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  33.94 
 
 
264 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.707847  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0812  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.34 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151893  normal  0.42525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18900  hypothetical protein  27.54 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0705821  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1846  electron transport complex protein RnfG  27.07 
 
 
208 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000030729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1400  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.21 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2321  electron transport complex protein RnfG  28.78 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0851  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  33.94 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.293062  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1134  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.14 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02968  electron transport complex protein RnfG  31.93 
 
 
212 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2357  electron transport complex protein RnfG  33.63 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1123  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.81 
 
 
200 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1868  electron transport complex protein RnfG  32.5 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803831  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2158  electron transport complex protein RnfG  29 
 
 
210 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.915166  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2560  electron transport complex protein RnfG  26.37 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0486766 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.3 
 
 
580 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2512  electron transport complex protein RnfG  31.62 
 
 
212 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2061  electron transport complex protein RnfG  25.97 
 
 
208 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000406522  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2040  electron transport complex protein RnfG  27.87 
 
 
208 aa  45.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.8254  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1489  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.55 
 
 
229 aa  45.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1541  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.57 
 
 
205 aa  45.8  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0904  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  33.94 
 
 
264 aa  45.4  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1834  electron transport complex protein RnfG  23.74 
 
 
215 aa  45.4  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.856968  normal  0.105681 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2277  electron transport complex protein RnfG  25.41 
 
 
212 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.050891  normal  0.93229 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2176  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.92 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2172  electron transport complex protein RnfG  30.77 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0934  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.87 
 
 
233 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4549  electron transport complex protein RnfG  25.41 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2263  electron transport complex protein RnfG  25.41 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2236  electron transport complex protein RnfG  29.41 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000312896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2108  electron transport complex protein RnfG  25.41 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.220327  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1920  electron transport complex protein RnfG  29.7 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0836  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, C subunit  25.64 
 
 
189 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1867  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.24 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1794  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.79 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  hitchhiker  0.000880554 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.95 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1899  electron transport complex protein RnfG  29.1 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00381532  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0063  FMN-binding domain-containing protein  27.14 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1783  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.08 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2249  electron transport complex protein RnfG  29.57 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000657737  normal  0.472384 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.92 
 
 
193 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2011  electron transport complex protein RnfG  29.57 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000172244  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0306  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.36 
 
 
215 aa  42.7  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2068  electron transport complex protein RnfG  29.91 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00132342  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1907  electron transport complex protein RnfG  29.91 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1159  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.04 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2383  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit C  29.06 
 
 
208 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0651  FMN-binding domain-containing protein  30.77 
 
 
203 aa  42.4  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.330764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>