33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1382 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1382  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  260  4e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.469514  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  53.73 
 
 
227 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2607  hypothetical protein  40.95 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113309  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0306  Rha family phage regulatory protein  36.07 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  48.39 
 
 
380 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  40.26 
 
 
284 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2510  Rha family phage regulatory protein  43.55 
 
 
207 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1251  putative phage regulatory protein, Rha family  42.62 
 
 
282 aa  60.8  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000124427  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0841  Cpp32  47.54 
 
 
188 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000551313  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0863  uncharacterized phage-encoded protein  49.12 
 
 
243 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.18472e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4461  putative antirepressor  42.62 
 
 
276 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  38.16 
 
 
204 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2989  phage regulatory protein, Rha family  40.74 
 
 
231 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.347787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1505  antirepressor  37.1 
 
 
252 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0597  phage regulatory protein, Rha family  41.38 
 
 
259 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a011  putative antirepressor, Rha family  37.35 
 
 
194 aa  50.8  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1464  phage anti-repressor protein  40.98 
 
 
232 aa  48.5  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521723  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0420  hypothetical protein  34.33 
 
 
250 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000377873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0434  hypothetical protein  34.33 
 
 
243 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0795  Rha family phage regulatory protein  48.78 
 
 
194 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2343  hypothetical protein  52.63 
 
 
311 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  40 
 
 
245 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2502  Rha family phage regulatory protein  41.27 
 
 
200 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526208  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  32.89 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0764  Rha family phage regulatory protein  46.34 
 
 
194 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1666  phage-encoded protein-like protein  46.34 
 
 
194 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3827  hypothetical protein  28.45 
 
 
237 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.691493  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3543  hypothetical protein  28.45 
 
 
242 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  45.28 
 
 
188 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1974  phage regulatory protein, Rha family  36.67 
 
 
256 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452898  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3314  phage-encoded protein-like  45.45 
 
 
242 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0897  phage regulatory protein, Rha family  41.67 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194242  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3131  phage-encoded protein-like protein  48.39 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>