15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0426 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0426  phage DNA-polymerase or DNA-primase  100 
 
 
303 aa  620  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3173  hypothetical protein  25.89 
 
 
417 aa  88.2  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1690  hypothetical protein  25.37 
 
 
370 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2965  hypothetical protein  23.76 
 
 
440 aa  70.5  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1647  hypothetical protein  31.37 
 
 
851 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  24.1 
 
 
751 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  26.47 
 
 
759 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2163  hypothetical protein  26.75 
 
 
189 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.140671 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3137  hypothetical protein  25.93 
 
 
647 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1589  hypothetical protein  25.97 
 
 
187 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.159507 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4210  hypothetical protein  22.69 
 
 
353 aa  49.7  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  25 
 
 
770 aa  46.6  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1658  hypothetical protein  25.19 
 
 
1172 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.815472  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0639  hypothetical protein  26.7 
 
 
848 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0775939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  23.78 
 
 
857 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>