More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0828 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0463  bifunctional cytidylate kinase/GTP-binding protein  74.83 
 
 		 709 aa  1103    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.816012  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1565  cytidylate kinase  53.83 
 
 		 725 aa  736    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15330  cytidylate kinase  49.41 
 
 		 755 aa  701    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201651  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0828  ribosome-associated GTPase EngA  100 
 
 		 734 aa  1498    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1924  ribosome-associated GTPase EngA  63.03 
 
 		 515 aa  615  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00693706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1272  GTP-binding protein EngA  64.11 
 
 		 490 aa  613  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19830  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  61.15 
 
 		 531 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1538  GTP-binding protein EngA  58.35 
 
 		 516 aa  585  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0501467  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1538  GTP-binding protein EngA  58.56 
 
 		 516 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000734498 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3115  GTP-binding protein EngA  60.68 
 
 		 496 aa  574  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2148  small GTP-binding protein  61.05 
 
 		 495 aa  564  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14040  GTP-binding protein EngA  59.78 
 
 		 512 aa  552  1e-156  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.732945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3059  small GTP-binding protein  57.03 
 
 		 493 aa  555  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296218  normal  0.0592019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2826  small GTP-binding protein  57.37 
 
 		 463 aa  536  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000744132  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1616  GTP-binding protein EngA  55.34 
 
 		 471 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5057  GTP-binding protein EngA  59.77 
 
 		 462 aa  529  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0472211 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15170  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  57.21 
 
 		 527 aa  531  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00982196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1210  GTP-binding protein EngA  57.01 
 
 		 463 aa  528  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1497  small GTP-binding protein  56.14 
 
 		 476 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2369  ribosome-associated GTPase EngA  58.58 
 
 		 482 aa  516  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.931884  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0980  ribosome-associated GTPase EngA  54.75 
 
 		 478 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2815  ribosome-associated GTPase EngA  57.4 
 
 		 478 aa  510  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.560303  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2503  GTP-binding protein EngA  55.84 
 
 		 461 aa  510  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3000  GTP-binding protein  56.4 
 
 		 472 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14830  GTP-binding protein EngA  57.34 
 
 		 470 aa  508  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.778091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1458  GTP-binding protein EngA  59.72 
 
 		 487 aa  503  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961762  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3493  GTP-binding protein EngA  57.18 
 
 		 479 aa  498  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.948039  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2981  ribosome-associated GTPase EngA  54.27 
 
 		 447 aa  494  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3274  GTP-binding protein EngA  56.3 
 
 		 470 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4051  small GTP-binding protein  54.97 
 
 		 483 aa  492  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567196  normal  0.594075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2942  GTP-binding protein EngA  57.74 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11728  GTP-binding protein EngA  56.33 
 
 		 463 aa  485  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000105319  normal  0.501933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2927  GTP-binding protein EngA  57.74 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2971  GTP-binding protein EngA  57.74 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1921  GTP-binding protein EngA  54.59 
 
 		 467 aa  472  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39722  hitchhiker  0.00139595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4423  small GTP-binding protein  52.47 
 
 		 465 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1233  small GTP-binding protein  53.95 
 
 		 458 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.765411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1930  GTP-binding protein EngA  55.74 
 
 		 467 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322711  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  44.55 
 
 		 444 aa  369  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  42.13 
 
 		 440 aa  361  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  43.68 
 
 		 436 aa  356  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  43.68 
 
 		 436 aa  355  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  43.68 
 
 		 436 aa  356  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  43.68 
 
 		 436 aa  356  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  43.68 
 
 		 436 aa  356  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  43.68 
 
 		 436 aa  356  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  43.68 
 
 		 436 aa  356  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  43.68 
 
 		 436 aa  356  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  42.76 
 
 		 436 aa  355  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  42.17 
 
 		 436 aa  355  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  42.99 
 
 		 436 aa  355  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  41.47 
 
 		 436 aa  353  5e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  42.07 
 
 		 436 aa  352  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  41.28 
 
 		 436 aa  351  2e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  40.7 
 
 		 440 aa  346  8e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  39.31 
 
 		 438 aa  346  1e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  39.31 
 
 		 438 aa  346  1e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.17 
 
 		 438 aa  342  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1562  GTP-binding protein EngA  40.46 
 
 		 436 aa  342  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.496113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1532  GTP-binding protein EngA  40.46 
 
 		 436 aa  342  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  40.82 
 
 		 441 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  40.72 
 
 		 441 aa  337  5e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  40.55 
 
 		 439 aa  336  9e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  40.09 
 
 		 438 aa  333  5e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  38.72 
 
 		 439 aa  333  9e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  40.5 
 
 		 440 aa  331  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  39.31 
 
 		 436 aa  330  8e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  39.45 
 
 		 441 aa  329  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  39.36 
 
 		 442 aa  328  3e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  38.98 
 
 		 438 aa  328  3e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  40.5 
 
 		 438 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03881  GTP-binding protein EngA  41.2 
 
 		 456 aa  327  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  38.34 
 
 		 437 aa  326  9e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  40.09 
 
 		 439 aa  326  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2896  GTP-binding protein EngA  41.18 
 
 		 453 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0739755  hitchhiker  0.000158888 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0885  GTP-binding protein EngA  42.03 
 
 		 452 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  40.27 
 
 		 493 aa  325  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0799  GTP-binding protein EngA  39.08 
 
 		 436 aa  325  3e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.940642  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  39.96 
 
 		 494 aa  324  4e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1337  small GTP-binding protein  40.14 
 
 		 438 aa  322  9.999999999999999e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0503171  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  39.46 
 
 		 441 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  40.23 
 
 		 444 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0893  GTP-binding protein EngA  41.08 
 
 		 427 aa  321  3e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177025  hitchhiker  0.0000000000000146029 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  38.94 
 
 		 436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  40 
 
 		 449 aa  320  7e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  38.86 
 
 		 441 aa  318  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  36.7 
 
 		 440 aa  318  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  39.27 
 
 		 442 aa  318  2e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  39.59 
 
 		 439 aa  317  5e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  38.81 
 
 		 440 aa  317  7e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04431  GTP-binding protein EngA  40.6 
 
 		 456 aa  316  8e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0422674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  38.58 
 
 		 441 aa  316  9e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl199  GTP-binding protein EngA  37.7 
 
 		 435 aa  315  9.999999999999999e-85  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.316366  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  38.81 
 
 		 440 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3566  ribosome-associated GTPase EngA  40.94 
 
 		 454 aa  316  9.999999999999999e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.173152  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  39.5 
 
 		 448 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1726  GTP-binding protein EngA  40.37 
 
 		 456 aa  315  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21511  GTP-binding protein EngA  41.11 
 
 		 461 aa  315  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  38.02 
 
 		 436 aa  314  3.9999999999999997e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1561  GTP-binding protein EngA  39.33 
 
 		 453 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.53751  normal  0.168181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>