61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0151 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0151  toxin-antitoxin system, toxin component, Fic family  100 
 
 		 239 aa  500  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.378079 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1067  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.44 
 
 		 203 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000031267  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1167  cell filamentation protein  38.97 
 
 		 203 aa  125  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153993  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4242  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.45 
 
 		 362 aa  122  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0546  putative Fic-related phage protein  36.46 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0312  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.98035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3643  cell filamentation protein Fic  32.47 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.533252  hitchhiker  0.0000580176 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4671  cell filamentation protein Fic  32.47 
 
 		 200 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.299298 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3737  cell filamentation protein Fic  32.47 
 
 		 200 aa  106  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03212  stationary-phase protein, cell division  32.47 
 
 		 200 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0351  cell filamentation protein Fic  32.47 
 
 		 200 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3831  cell filamentation protein Fic  32.47 
 
 		 200 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3558  cell filamentation protein Fic  32.47 
 
 		 200 aa  106  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03164  hypothetical protein  32.47 
 
 		 200 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.385367  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0351  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.47 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.665169  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3720  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.03 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.328227  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3788  cell filamentation protein Fic  40.51 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536724 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1130  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.63 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1983  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.94 
 
 		 189 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00370142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4058  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.08 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3775  cell filamentation protein Fic  32.28 
 
 		 200 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.593051 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3667  cell filamentation protein Fic  32.28 
 
 		 200 aa  98.2  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.328505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3741  cell filamentation protein Fic  32.28 
 
 		 200 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  hitchhiker  0.00689442 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3838  cell filamentation protein Fic  32.28 
 
 		 200 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3667  cell filamentation protein Fic  32.28 
 
 		 200 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.128667  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4684  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.16 
 
 		 175 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.908196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5760  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.92 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2867  mobilization/cell filamentation proteins-like  37.66 
 
 		 201 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00242237  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3268  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.97 
 
 		 194 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0815265  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3644  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.53 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0278  cell division protein  32.37 
 
 		 249 aa  89  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0316565  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0942  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.91 
 
 		 194 aa  88.6  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.052595  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9907  cell filamentation protein  30.35 
 
 		 354 aa  88.6  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13672  cell filamentation protein fic  31.61 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0578258  normal  0.06388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3265  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.89 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1523  cell filamentation protein  33.97 
 
 		 202 aa  85.5  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0384  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.91 
 
 		 287 aa  85.5  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.107941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2140  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.52 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0238558  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4544  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.82 
 
 		 349 aa  82  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33143  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0913  cell filamentation protein Fic  31.35 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0344  Fic family protein  29.84 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.201398  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0216  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.33 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1247  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.18 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3381  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.07 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1027  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.89 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000174248  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0608  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.76 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.620688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0219  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.23 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0548  Fic family protein  30.87 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0721  cell division protein  31.03 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000102774  normal  0.908113 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1367  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.21 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0441  cell filamentation-like protein  29.86 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.701812  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1657  cell filamentation protein fic  29.37 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4358  Fic protein family  31.78 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.069593  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5375  hypothetical protein  37.66 
 
 		 105 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.392977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3724  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.71 
 
 		 241 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.093311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3971  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.19 
 
 		 330 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5579  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.81 
 
 		 432 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.117787  normal  0.0799593 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4941  mobile mystery protein B  25.95 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6305  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.29 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2565  mobile mystery protein B  26.47 
 
 		 194 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3534  mobile mystery protein B  24.82 
 
 		 194 aa  42.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>