24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4117 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0839  hypothetical protein  47.34 
 
 
783 aa  689    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.953806  normal  0.146374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4117  hypothetical protein  100 
 
 
785 aa  1612    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4917  hypothetical protein  37.36 
 
 
780 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4372  hypothetical protein  35.35 
 
 
784 aa  451  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1825  hypothetical protein  23.4 
 
 
824 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0789  hypothetical protein  27.4 
 
 
847 aa  143  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.968765  hitchhiker  0.000702258 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1097  hypothetical protein  26.6 
 
 
816 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1292  protein of unknown function DUF524  28.86 
 
 
836 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.452716  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0971  hypothetical protein  27.73 
 
 
815 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0928  hypothetical protein  26.46 
 
 
815 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0874  hypothetical protein  26.46 
 
 
815 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2173  hypothetical protein  27.1 
 
 
833 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1117  hypothetical protein  26.94 
 
 
825 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0045  protein of unknown function DUF524  26.63 
 
 
550 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.724745  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1454  protein of unknown function DUF524  22.24 
 
 
758 aa  102  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0121  hypothetical protein  30.64 
 
 
549 aa  89.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  30.71 
 
 
792 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0005  hypothetical protein  27.1 
 
 
762 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.596287  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2402  protein of unknown function DUF524  27.54 
 
 
654 aa  74.7  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.63975  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4062  hypothetical protein  28.24 
 
 
553 aa  65.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0240971  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2250  hypothetical protein  24.76 
 
 
536 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.769234  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5204  hypothetical protein  32.58 
 
 
389 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4160  hypothetical protein  25.88 
 
 
516 aa  48.5  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00251494  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0559  protein of unknown function DUF524  26.29 
 
 
492 aa  45.8  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.864324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>