22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0005 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0005  hypothetical protein  100 
 
 		 762 aa  1551    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.596287  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5203  hypothetical protein  41.69 
 
 		 320 aa  197  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5204  hypothetical protein  32.73 
 
 		 389 aa  187  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2402  protein of unknown function DUF524  29.15 
 
 		 654 aa  159  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.63975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0789  hypothetical protein  23.94 
 
 		 847 aa  128  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.968765  hitchhiker  0.000702258 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2173  hypothetical protein  26.92 
 
 		 833 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0121  hypothetical protein  28.78 
 
 		 549 aa  107  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1292  protein of unknown function DUF524  27.42 
 
 		 836 aa  107  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.452716  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0971  hypothetical protein  24.91 
 
 		 815 aa  107  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0874  hypothetical protein  25.43 
 
 		 815 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0928  hypothetical protein  25.43 
 
 		 815 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1825  hypothetical protein  21.25 
 
 		 824 aa  100  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1097  hypothetical protein  25.91 
 
 		 816 aa  97.8  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4372  hypothetical protein  25.63 
 
 		 784 aa  78.2  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4917  hypothetical protein  23.09 
 
 		 780 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0839  hypothetical protein  25.55 
 
 		 783 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.953806  normal  0.146374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4117  hypothetical protein  27.1 
 
 		 785 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1117  hypothetical protein  21.91 
 
 		 825 aa  59.3  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1454  protein of unknown function DUF524  19.24 
 
 		 758 aa  55.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0045  protein of unknown function DUF524  24.9 
 
 		 550 aa  55.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.724745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4062  hypothetical protein  22.16 
 
 		 553 aa  45.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0240971  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  29.92 
 
 		 792 aa  44.3  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>