21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0121 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0121  hypothetical protein  100 
 
 		 549 aa  1118    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4917  hypothetical protein  26.52 
 
 		 780 aa  107  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0005  hypothetical protein  28.78 
 
 		 762 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.596287  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2402  protein of unknown function DUF524  26.15 
 
 		 654 aa  103  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.63975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2173  hypothetical protein  25.05 
 
 		 833 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0839  hypothetical protein  27.83 
 
 		 783 aa  94.7  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.953806  normal  0.146374 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1292  protein of unknown function DUF524  23.23 
 
 		 836 aa  93.2  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.452716  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0971  hypothetical protein  23.67 
 
 		 815 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0789  hypothetical protein  26.23 
 
 		 847 aa  91.7  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.968765  hitchhiker  0.000702258 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1097  hypothetical protein  22.22 
 
 		 816 aa  92  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4117  hypothetical protein  30.64 
 
 		 785 aa  89.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4372  hypothetical protein  24.7 
 
 		 784 aa  87.4  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0928  hypothetical protein  22.62 
 
 		 815 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0874  hypothetical protein  22.62 
 
 		 815 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1825  hypothetical protein  23.24 
 
 		 824 aa  79.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5204  hypothetical protein  32.45 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4062  hypothetical protein  28.35 
 
 		 553 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0240971  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2250  hypothetical protein  26.15 
 
 		 536 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.769234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0045  protein of unknown function DUF524  28.32 
 
 		 550 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.724745  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1117  hypothetical protein  27.31 
 
 		 825 aa  45.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4160  hypothetical protein  25.28 
 
 		 516 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00251494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>