16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4062 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2250  hypothetical protein  66.29 
 
 		 536 aa  641    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.769234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4062  hypothetical protein  100 
 
 		 553 aa  1097    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0240971  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4160  hypothetical protein  30.51 
 
 		 516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00251494  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4117  hypothetical protein  28.32 
 
 		 785 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0839  hypothetical protein  25 
 
 		 783 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.953806  normal  0.146374 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4372  hypothetical protein  24.38 
 
 		 784 aa  74.7  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1117  hypothetical protein  24.13 
 
 		 825 aa  74.3  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0045  protein of unknown function DUF524  28.03 
 
 		 550 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.724745  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4917  hypothetical protein  22.6 
 
 		 780 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0789  hypothetical protein  18.89 
 
 		 847 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.968765  hitchhiker  0.000702258 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0121  hypothetical protein  28.2 
 
 		 549 aa  65.1  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0559  protein of unknown function DUF524  40.23 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.864324 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1825  hypothetical protein  18.94 
 
 		 824 aa  58.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0005  hypothetical protein  23.31 
 
 		 762 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.596287  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5204  hypothetical protein  25.98 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0027  hypothetical protein  25.97 
 
 		 479 aa  50.4  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>