24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4917 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4372  hypothetical protein  60.33 
 
 
784 aa  973    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4917  hypothetical protein  100 
 
 
780 aa  1623    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0839  hypothetical protein  36.22 
 
 
783 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.953806  normal  0.146374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4117  hypothetical protein  37.36 
 
 
785 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1097  hypothetical protein  26.71 
 
 
816 aa  144  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0971  hypothetical protein  25.74 
 
 
815 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0874  hypothetical protein  25.26 
 
 
815 aa  138  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0928  hypothetical protein  25.26 
 
 
815 aa  138  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2173  hypothetical protein  24.95 
 
 
833 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0789  hypothetical protein  26.51 
 
 
847 aa  125  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.968765  hitchhiker  0.000702258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1454  protein of unknown function DUF524  22.46 
 
 
758 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1292  protein of unknown function DUF524  25.05 
 
 
836 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.452716  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1825  hypothetical protein  23.62 
 
 
824 aa  114  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1117  hypothetical protein  23.21 
 
 
825 aa  107  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0121  hypothetical protein  26.52 
 
 
549 aa  107  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0045  protein of unknown function DUF524  21.89 
 
 
550 aa  95.5  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.724745  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0005  hypothetical protein  23.09 
 
 
762 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.596287  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2402  protein of unknown function DUF524  21.58 
 
 
654 aa  74.7  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.63975  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4062  hypothetical protein  25.31 
 
 
553 aa  68.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0240971  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  34.19 
 
 
792 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2250  hypothetical protein  22.71 
 
 
536 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.769234  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0434  hypothetical protein  25.9 
 
 
621 aa  47  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4160  hypothetical protein  22.87 
 
 
516 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00251494  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0559  protein of unknown function DUF524  28.07 
 
 
492 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.864324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>