15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2250 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2250  hypothetical protein  100 
 
 		 536 aa  1062    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.769234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4062  hypothetical protein  66.29 
 
 		 553 aa  645    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0240971  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4160  hypothetical protein  31.64 
 
 		 516 aa  161  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00251494  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0559  protein of unknown function DUF524  39.58 
 
 		 492 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.864324 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0839  hypothetical protein  22.59 
 
 		 783 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.953806  normal  0.146374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4117  hypothetical protein  24.95 
 
 		 785 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1117  hypothetical protein  22.7 
 
 		 825 aa  68.6  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4372  hypothetical protein  21.32 
 
 		 784 aa  67  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0121  hypothetical protein  27.15 
 
 		 549 aa  65.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0789  hypothetical protein  19.38 
 
 		 847 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.968765  hitchhiker  0.000702258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1825  hypothetical protein  19.11 
 
 		 824 aa  64.7  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4917  hypothetical protein  20.22 
 
 		 780 aa  64.7  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0045  protein of unknown function DUF524  28.74 
 
 		 550 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.724745  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5204  hypothetical protein  25.81 
 
 		 389 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2173  hypothetical protein  20.63 
 
 		 833 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>