17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5204 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5204  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  785    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0005  hypothetical protein  32.73 
 
 
762 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.596287  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0789  hypothetical protein  21.51 
 
 
847 aa  77.4  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.968765  hitchhiker  0.000702258 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0121  hypothetical protein  32.45 
 
 
549 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2402  protein of unknown function DUF524  23.6 
 
 
654 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.63975  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0971  hypothetical protein  23.79 
 
 
815 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2173  hypothetical protein  23.81 
 
 
833 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1097  hypothetical protein  23.05 
 
 
816 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0874  hypothetical protein  24.36 
 
 
815 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0928  hypothetical protein  24.36 
 
 
815 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4117  hypothetical protein  32.58 
 
 
785 aa  56.6  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1292  protein of unknown function DUF524  21.05 
 
 
836 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.452716  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4372  hypothetical protein  27.34 
 
 
784 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4062  hypothetical protein  24.78 
 
 
553 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0240971  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1825  hypothetical protein  18.57 
 
 
824 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4917  hypothetical protein  30.38 
 
 
780 aa  43.5  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2250  hypothetical protein  22.58 
 
 
536 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.769234  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>