21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1117 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1117  hypothetical protein  100 
 
 
825 aa  1691    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0045  protein of unknown function DUF524  34.3 
 
 
550 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.724745  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0789  hypothetical protein  26.93 
 
 
847 aa  232  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.968765  hitchhiker  0.000702258 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2173  hypothetical protein  27.72 
 
 
833 aa  231  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1292  protein of unknown function DUF524  27.57 
 
 
836 aa  226  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.452716  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1825  hypothetical protein  25.75 
 
 
824 aa  225  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0874  hypothetical protein  26.06 
 
 
815 aa  204  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0928  hypothetical protein  26.06 
 
 
815 aa  204  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0971  hypothetical protein  26.2 
 
 
815 aa  203  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1097  hypothetical protein  25.56 
 
 
816 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4117  hypothetical protein  26.94 
 
 
785 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0839  hypothetical protein  23.53 
 
 
783 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.953806  normal  0.146374 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4372  hypothetical protein  25.6 
 
 
784 aa  112  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4917  hypothetical protein  23.21 
 
 
780 aa  108  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  24.77 
 
 
792 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4062  hypothetical protein  23.72 
 
 
553 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0240971  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1454  protein of unknown function DUF524  18.95 
 
 
758 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0005  hypothetical protein  21.91 
 
 
762 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.596287  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2250  hypothetical protein  22.63 
 
 
536 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.769234  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0121  hypothetical protein  27.31 
 
 
549 aa  45.4  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2402  protein of unknown function DUF524  29.11 
 
 
654 aa  45.4  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.63975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>