16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3510 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3510  restriction endonuclease  100 
 
 		 233 aa  480  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362685  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2459  restriction endonuclease  35.29 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0102713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2604  restriction endonuclease  41.86 
 
 		 266 aa  119  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6910  hypothetical protein  32.04 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2536  hypothetical protein  29.13 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2490  hypothetical protein  39.74 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1811  hypothetical protein  25.19 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0693718  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0179  hypothetical protein  25.3 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0225  hypothetical protein  25.56 
 
 		 267 aa  46.2  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1870  hypothetical protein  25.3 
 
 		 271 aa  45.8  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  24.19 
 
 		 421 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  25.69 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0041  hypothetical protein  29.79 
 
 		 338 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777357  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0226  hypothetical protein  27.5 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481584  normal  0.43543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  21.95 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01945  hypothetical protein  25 
 
 		 386 aa  42.4  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>