12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2490 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2490  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  547  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1870  hypothetical protein  28.68 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0179  hypothetical protein  31.85 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0226  hypothetical protein  38.89 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481584  normal  0.43543 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0225  hypothetical protein  33.61 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1811  hypothetical protein  37.17 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0693718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2590  hypothetical protein  36.63 
 
 		 368 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3510  restriction endonuclease  39.74 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0362685  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2459  restriction endonuclease  39.19 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0102713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2604  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5185  restriction endonuclease  32.2 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2536  hypothetical protein  36.67 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>