35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2684 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1489  hypothetical protein  64.35 
 
 		 623 aa  832    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1391  hypothetical protein  63.53 
 
 		 619 aa  784    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.86997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2515  hypothetical protein  57.28 
 
 		 652 aa  717    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0758792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2684  hypothetical protein  100 
 
 		 621 aa  1257    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1629  hypothetical protein  61.55 
 
 		 619 aa  753    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2597  hypothetical protein  62.26 
 
 		 619 aa  759    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1651  hypothetical protein  46.27 
 
 		 624 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1010  hypothetical protein  26.16 
 
 		 634 aa  114  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101857  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0935  hypothetical protein  27.04 
 
 		 531 aa  106  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0223  hypothetical protein  35.06 
 
 		 881 aa  95.9  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0932  hypothetical protein  27.66 
 
 		 541 aa  95.9  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.315139  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0051  hypothetical protein  26.12 
 
 		 613 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.062012 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2017  hypothetical protein  31.15 
 
 		 880 aa  89.7  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000248245  normal  0.284056 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2186  hypothetical protein  31.03 
 
 		 882 aa  87.4  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000183684  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1794  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1245 aa  86.3  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.69552  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2243  hypothetical protein  33.16 
 
 		 875 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2374  hypothetical protein  32.42 
 
 		 881 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0423348  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0333  hypothetical protein  31.79 
 
 		 880 aa  84.7  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0581  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1009 aa  84  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.272409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01380  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1109 aa  80.9  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.369989  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0197  hypothetical protein  30.81 
 
 		 880 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2927  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1001 aa  78.2  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000253968 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1626  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1093 aa  77.4  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2144  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1099 aa  77.4  0.0000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0307  hypothetical protein  27.89 
 
 		 993 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0238  hypothetical protein  30.69 
 
 		 947 aa  75.5  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1844  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1005 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0832694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4667  hypothetical protein  28 
 
 		 1076 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0836755  hitchhiker  0.00000000312371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1942  hypothetical protein  26.35 
 
 		 580 aa  70.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0873468  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2085  hypothetical protein  27.36 
 
 		 989 aa  70.5  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4967  hypothetical protein  29.84 
 
 		 991 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.736334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1528  hypothetical protein  25.64 
 
 		 984 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0809349 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0968  conserved hypothetical protein, membrane  25.63 
 
 		 1103 aa  66.6  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.688922  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0773  hypothetical protein  22.51 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000042468  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0195  hypothetical protein  24.23 
 
 		 522 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.966603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>