More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2352 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2352  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
381 aa  790    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0543  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  72.97 
 
 
381 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0556  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  72.44 
 
 
381 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000759492 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2182  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.26 
 
 
380 aa  333  3e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000233071  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.42 
 
 
379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.42 
 
 
380 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  39.58 
 
 
379 aa  293  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  39.31 
 
 
379 aa  292  9e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  39.31 
 
 
379 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.47 
 
 
386 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  39.31 
 
 
379 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  39.31 
 
 
379 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  39.31 
 
 
379 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.31 
 
 
379 aa  290  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  39.31 
 
 
379 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  39.05 
 
 
379 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  39.05 
 
 
379 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.27 
 
 
386 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.79 
 
 
379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.32 
 
 
379 aa  281  2e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1260  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.7 
 
 
394 aa  280  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.334789  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  39.11 
 
 
379 aa  279  7e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  38.56 
 
 
379 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  38.56 
 
 
379 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.79 
 
 
380 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.11 
 
 
376 aa  276  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.53 
 
 
379 aa  275  8e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4720  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.7 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.53 
 
 
381 aa  270  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.26 
 
 
379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2136  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.52 
 
 
380 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281355 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  39.84 
 
 
381 aa  269  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  39.58 
 
 
376 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.63 
 
 
388 aa  268  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000954759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  39.58 
 
 
376 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  39.58 
 
 
376 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  39.58 
 
 
381 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  39.58 
 
 
376 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  39.58 
 
 
376 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0198  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40 
 
 
387 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140883  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  39.58 
 
 
381 aa  267  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1874  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.16 
 
 
387 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33835  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  39.58 
 
 
376 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2281  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.46 
 
 
380 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2780  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.67 
 
 
390 aa  266  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0393743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.36 
 
 
390 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  37.99 
 
 
379 aa  266  5e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.84 
 
 
380 aa  266  5e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3933  Acyl-CoA dehydrogenase-like  38.1 
 
 
390 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.31 
 
 
376 aa  265  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2192  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.73 
 
 
380 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.516178  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1739  isovaleryl-CoA dehydrogenase  37.73 
 
 
390 aa  265  7e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.52 
 
 
387 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119681  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4263  acyl-CoA dehydrogenase-like  37.04 
 
 
390 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  0.561312 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40 
 
 
377 aa  264  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1665  butyryl-CoA dehydrogenase  38.46 
 
 
380 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1804  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.57 
 
 
390 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392184  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3289  isovaleryl-CoA dehydrogenase  37.73 
 
 
390 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4272  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.36 
 
 
390 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0196507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.31 
 
 
389 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4378  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.04 
 
 
381 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2033  isovaleryl-CoA dehydrogenase  36.94 
 
 
387 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0666462  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1782  butyryl-CoA dehydrogenase  38.73 
 
 
379 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.257154  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.11 
 
 
381 aa  259  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.05 
 
 
380 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0268  butyryl-CoA dehydrogenase  38.52 
 
 
379 aa  259  8e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0020  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.26 
 
 
382 aa  257  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.06 
 
 
382 aa  257  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3451  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.47 
 
 
377 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0092  butyryl-CoA dehydrogenase  39.31 
 
 
378 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0802  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.54 
 
 
393 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0542  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.54 
 
 
393 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470015  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3018  Acyl-CoA dehydrogenase  36.36 
 
 
407 aa  256  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6510  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.77 
 
 
381 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.41485  normal  0.721434 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1608  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.54 
 
 
393 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3387  isovaleryl-CoA dehydrogenase  36.24 
 
 
391 aa  256  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197098  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0654  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.54 
 
 
393 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548122  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2056  putative isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.54 
 
 
393 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108299  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1959  putative isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.54 
 
 
393 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0471  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.54 
 
 
393 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4588  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.02 
 
 
393 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3973  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.47 
 
 
377 aa  256  7e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78306  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4086  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.47 
 
 
377 aa  256  7e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.349393 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.56 
 
 
379 aa  256  7e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0202  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.53 
 
 
382 aa  256  7e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221874  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.07 
 
 
380 aa  255  8e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0017  isovaleryl-CoA dehydrogenase  37.99 
 
 
382 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0947  isovaleryl-CoA dehydrogenase  38.28 
 
 
393 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.11 
 
 
380 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02412  isovaleryl-CoA dehydrogenase  36.41 
 
 
389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.719746  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0423  isovaleryl-CoA dehydrogenase  37.76 
 
 
414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.733872  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3127  acyl-CoA dehydrogenase-like  37.76 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105998  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5240  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.76 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288959  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.67 
 
 
383 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0247  Acyl-CoA dehydrogenase  36.91 
 
 
378 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.73 
 
 
388 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5121  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.76 
 
 
393 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.975401  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.76 
 
 
393 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  38.32 
 
 
381 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  38.32 
 
 
381 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>