30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0704 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0704  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2978  hypothetical protein  54.43 
 
 		 82 aa  86.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0496  hypothetical protein  51.9 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0374  hypothetical protein  45 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.72923  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0623  TRASH domain protein  44.16 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.34319e-36 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0609  TRASH domain protein  45.45 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0295  TRASH domain-containing protein  39.02 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1968  TRASH  41.86 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1187  TRASH domain-containing protein  34.44 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.254659  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2229  copper-translocating P-type ATPase  46.15 
 
 		 787 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0052  TRASH domain-containing protein  30.86 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1429  TRASH domain-containing protein  34.12 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  40.43 
 
 		 837 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3019  permease  30.77 
 
 		 463 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0363  TRASH domain protein  30.59 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00964883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 846 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1349  TRASH domain protein  32.1 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.407824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  38.1 
 
 		 805 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  46.15 
 
 		 441 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2487  TRASH domain-containing protein  31.33 
 
 		 89 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  45.71 
 
 		 817 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  45.71 
 
 		 817 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  45.24 
 
 		 767 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 778 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7156  heavy metal translocating P-type ATPase  51.11 
 
 		 841 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.802165 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  40.35 
 
 		 846 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0231  hypothetical protein  42.5 
 
 		 299 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  42.59 
 
 		 798 aa  40  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  38.3 
 
 		 831 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4258  permease  45 
 
 		 466 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>