13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0052 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0052  TRASH domain-containing protein  100 
 
 		 85 aa  179  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2978  hypothetical protein  32.93 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48983  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1968  TRASH  38.3 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2487  TRASH domain-containing protein  27.91 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1349  TRASH domain protein  35.37 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.407824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0374  hypothetical protein  29.63 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.72923  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1187  TRASH domain-containing protein  33.33 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.254659  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0496  hypothetical protein  30.12 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0704  hypothetical protein  30.86 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0249  hypothetical protein  51.52 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1455  TRASH  28.75 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00129945  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1429  TRASH domain-containing protein  45.65 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0363  TRASH domain protein  42.22 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00964883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>