20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2487 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2487  TRASH domain-containing protein  100 
 
 		 89 aa  182  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1349  TRASH domain protein  33.33 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.407824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0052  TRASH domain-containing protein  27.91 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2978  hypothetical protein  31.71 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48983  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0249  hypothetical protein  36.84 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0295  TRASH domain-containing protein  32.95 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0374  hypothetical protein  36.14 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.72923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0496  hypothetical protein  31.71 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4564  permease  32.14 
 
 		 441 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2110  heavy metal translocating P-type ATPase  46.15 
 
 		 776 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 795 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2038  hypothetical protein  35.53 
 
 		 301 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0608424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0704  hypothetical protein  31.33 
 
 		 79 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2307  copper-translocating P-type ATPase  45.95 
 
 		 783 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 846 aa  41.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  41.03 
 
 		 817 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  41.03 
 
 		 817 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 810 aa  40.4  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 835 aa  40  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 778 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>