25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0639 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0639  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  199  8e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2780  hypothetical protein  71.15 
 
 
104 aa  149  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000634208  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0582  hypothetical protein  83.33 
 
 
104 aa  142  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000451193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0595  hypothetical protein  81.37 
 
 
104 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138019 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2461  hypothetical protein  70.3 
 
 
284 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0694  hypothetical protein  68 
 
 
103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000327351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0392  hypothetical protein  62.89 
 
 
103 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000101925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1386  hypothetical protein  49.23 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000365631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2896  hypothetical protein  47.69 
 
 
90 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.63466e-22 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2264  hypothetical protein  40.45 
 
 
101 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000849761  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1763  hypothetical protein  41.54 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.303633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0385  hypothetical protein  42.86 
 
 
81 aa  50.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4341  hypothetical protein  32.67 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03405  hypothetical protein  32.08 
 
 
124 aa  47  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2987  hypothetical protein  39.34 
 
 
178 aa  46.2  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3552  hypothetical protein  37.5 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00139004  normal  0.0763247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1155  hypothetical protein  30.36 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0011956  hitchhiker  0.0048484 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0152  hypothetical protein  35.44 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0879  hypothetical protein  44.44 
 
 
204 aa  44.3  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.765052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2920  hypothetical protein  27.93 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1364  hypothetical protein  27.03 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2463  hypothetical protein  29.21 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.361588  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0532  hypothetical protein  30.85 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.094496  unclonable  0.000000000020236 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0362  hypothetical protein  30.85 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0479  hypothetical protein  30.48 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.100545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>