25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0367 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0367  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 200 aa  410  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.379322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3226  peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.201779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3277  lysM domain-containing protein  36.21 
 
 		 235 aa  149  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0695  Peptidoglycan-binding LysM  43.15 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0706  Peptidoglycan-binding LysM  40.51 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0775900000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0582  Peptidoglycan-binding LysM  37.56 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.628153  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  45.83 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  45.83 
 
 		 161 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  41.3 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  43.75 
 
 		 161 aa  45.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  45.83 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  30.77 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  30.7 
 
 		 356 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  35.42 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  29.25 
 
 		 420 aa  42.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  33.85 
 
 		 663 aa  42  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 163 aa  42.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  42.55 
 
 		 156 aa  42  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  32.05 
 
 		 568 aa  42  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  36.73 
 
 		 143 aa  41.6  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  38.46 
 
 		 166 aa  41.6  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 162 aa  41.2  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1331  CHAP domain-containing protein  45.83 
 
 		 372 aa  41.2  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1306  CHAP domain-containing protein  45.83 
 
 		 372 aa  41.2  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.387302  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 162 aa  41.2  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>