More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3827 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3827  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
403 aa  804    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241233  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1758  acetyl-CoA acetyltransferase  69.73 
 
 
404 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1805  acetyl-CoA acetyltransferase  69.73 
 
 
404 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1739  acetyl-CoA acetyltransferase  69.48 
 
 
404 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126801  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2726  acetyl-CoA acetyltransferase  68.49 
 
 
404 aa  563  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3929  acetyl-CoA acetyltransferase  70.72 
 
 
403 aa  553  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.041846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4368  acetyl-CoA acetyltransferase  65.92 
 
 
405 aa  548  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1976  acetyl-CoA acetyltransferase  65.76 
 
 
405 aa  549  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1802  acetyl-CoA acetyltransferase  68.58 
 
 
407 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7151  acetyl-CoA acetyltransferase  67 
 
 
405 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1860  acetyl-CoA acetyltransferase  67.99 
 
 
402 aa  528  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00028581  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1524  acetyl-CoA acetyltransferase  66.83 
 
 
407 aa  524  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4166  acetyl-CoA acetyltransferase  62.34 
 
 
407 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0142  acetyl-CoA acetyltransferase  59.37 
 
 
402 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.771451  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0124  acetyl-CoA acetyltransferase  59.37 
 
 
402 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0192  acetyl-CoA acetyltransferase  59.61 
 
 
402 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1347  acetyl-CoA acetyltransferase  61.85 
 
 
403 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.901733 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7332  acetyl-CoA acetyltransferase  56.23 
 
 
401 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213335  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6898  acetyl-CoA acetyltransferase  54.66 
 
 
398 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1222  acetyl-CoA acetyltransferase  54.81 
 
 
404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0492457  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2896  acetyl-CoA acetyltransferase  54.93 
 
 
404 aa  403  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  49.25 
 
 
390 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  47.52 
 
 
391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  47.52 
 
 
391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  47.52 
 
 
391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  47.52 
 
 
391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  47.52 
 
 
391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  47.28 
 
 
391 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  48.88 
 
 
398 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  47.52 
 
 
391 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  47.28 
 
 
391 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3780  acetyl-CoA acetyltransferase  47.28 
 
 
391 aa  353  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3852  acetyl-CoA acetyltransferase  46.53 
 
 
391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647198  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  47.24 
 
 
394 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  49 
 
 
392 aa  350  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  47.63 
 
 
394 aa  350  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  47.63 
 
 
394 aa  350  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2722  acetyl-CoA acetyltransferase  45.79 
 
 
391 aa  349  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1491  acetyl-CoA acetyltransferase  45.85 
 
 
393 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  47.88 
 
 
394 aa  347  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  47.88 
 
 
394 aa  347  3e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  46.88 
 
 
394 aa  345  7e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  48.76 
 
 
394 aa  344  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5917  acetyl-CoA acetyltransferase  48.63 
 
 
393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4781  acetyl-CoA acetyltransferase  48.63 
 
 
393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909397  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  47.03 
 
 
394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  46.53 
 
 
394 aa  342  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  47.41 
 
 
392 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  46.78 
 
 
394 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  46.78 
 
 
394 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  46.53 
 
 
392 aa  340  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  47.09 
 
 
393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3117  acetyl-CoA acetyltransferase  46.12 
 
 
393 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  45.52 
 
 
393 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  47.03 
 
 
396 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2256  acetyl-CoA acetyltransferase  47.26 
 
 
390 aa  338  8e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.672895  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  45.75 
 
 
392 aa  338  9e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  46.12 
 
 
394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  47.28 
 
 
393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  48.02 
 
 
394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  46.75 
 
 
392 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  46 
 
 
392 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  43.89 
 
 
391 aa  336  5e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  47.76 
 
 
390 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  45.43 
 
 
392 aa  335  5.999999999999999e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3822  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 
393 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  44.91 
 
 
396 aa  335  7e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2284  acetyl-CoA acetyltransferase  45.68 
 
 
392 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4150  acetyl-CoA acetyltransferase  46.35 
 
 
393 aa  335  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  47.16 
 
 
392 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  46.49 
 
 
401 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  44.5 
 
 
392 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1380  acetyl-CoA acetyltransferase  46.02 
 
 
391 aa  333  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2005  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  47.26 
 
 
390 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  44.28 
 
 
393 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  44.94 
 
 
392 aa  333  3e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  45.25 
 
 
392 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  44.78 
 
 
394 aa  332  6e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0427  acetyl-CoA acetyltransferase  44.25 
 
 
391 aa  332  6e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  44.5 
 
 
392 aa  332  9e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0832  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  47.76 
 
 
390 aa  332  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0844376 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4344  acetyl-CoA acetyltransferase  46.1 
 
 
408 aa  331  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  47.03 
 
 
402 aa  331  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2026  acetyl-CoA acetyltransferase  47.01 
 
 
391 aa  331  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  46.65 
 
 
392 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  47.89 
 
 
393 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  46.65 
 
 
392 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0641  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  47.01 
 
 
390 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  47.64 
 
 
393 aa  329  7e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  46.91 
 
 
392 aa  328  8e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  45.79 
 
 
394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  48.15 
 
 
398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  46.99 
 
 
403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  45.3 
 
 
393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  45.16 
 
 
392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1134  acetyl-CoA acetyltransferase  43.11 
 
 
398 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3374  acetyl-CoA acetyltransferase  45.98 
 
 
393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0025  beta-ketothiolase  48.27 
 
 
395 aa  326  5e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  45.3 
 
 
393 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  45.3 
 
 
393 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>