More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0192 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6898  acetyl-CoA acetyltransferase  79.05 
 
 
398 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0142  acetyl-CoA acetyltransferase  92.04 
 
 
402 aa  761    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.771451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0192  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
402 aa  817    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0124  acetyl-CoA acetyltransferase  92.54 
 
 
402 aa  766    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7332  acetyl-CoA acetyltransferase  72.82 
 
 
401 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213335  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2896  acetyl-CoA acetyltransferase  69.58 
 
 
404 aa  565  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1222  acetyl-CoA acetyltransferase  67.25 
 
 
404 aa  558  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0492457  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7151  acetyl-CoA acetyltransferase  57.66 
 
 
405 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3827  acetyl-CoA acetyltransferase  59.61 
 
 
403 aa  433  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1860  acetyl-CoA acetyltransferase  56.76 
 
 
402 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00028581  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1805  acetyl-CoA acetyltransferase  53.17 
 
 
404 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2726  acetyl-CoA acetyltransferase  54.43 
 
 
404 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1758  acetyl-CoA acetyltransferase  53.17 
 
 
404 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1739  acetyl-CoA acetyltransferase  52.93 
 
 
404 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126801  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3929  acetyl-CoA acetyltransferase  56.65 
 
 
403 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.041846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1976  acetyl-CoA acetyltransferase  52.2 
 
 
405 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4368  acetyl-CoA acetyltransferase  52.1 
 
 
405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1802  acetyl-CoA acetyltransferase  55.22 
 
 
407 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4166  acetyl-CoA acetyltransferase  54.21 
 
 
407 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1347  acetyl-CoA acetyltransferase  52.97 
 
 
403 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.901733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1524  acetyl-CoA acetyltransferase  50.97 
 
 
407 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  46.65 
 
 
396 aa  340  4e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2280  acetyl-CoA acetyltransferases  44.42 
 
 
426 aa  333  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  44.14 
 
 
394 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  44.53 
 
 
392 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  44.64 
 
 
392 aa  331  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  43.7 
 
 
393 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  44.39 
 
 
393 aa  329  7e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  45.02 
 
 
401 aa  328  8e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  44.12 
 
 
393 aa  328  8e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  43.84 
 
 
393 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  44.33 
 
 
399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  43.84 
 
 
393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  43.84 
 
 
393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  43.95 
 
 
393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  43.95 
 
 
393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  47.03 
 
 
394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  47.03 
 
 
394 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  43.7 
 
 
393 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  45.27 
 
 
392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  43.7 
 
 
393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  43.7 
 
 
393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  43.7 
 
 
393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  44.2 
 
 
393 aa  326  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  45.02 
 
 
392 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  43.28 
 
 
392 aa  325  9e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 
393 aa  325  1e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  43.87 
 
 
393 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  45.79 
 
 
394 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  43.46 
 
 
393 aa  323  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  43.7 
 
 
393 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  45.02 
 
 
392 aa  323  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  43.7 
 
 
393 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  43.45 
 
 
398 aa  323  5e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  44.69 
 
 
393 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  45.14 
 
 
403 aa  322  6e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  43.7 
 
 
393 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  43.21 
 
 
393 aa  322  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  44.69 
 
 
393 aa  322  8e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  43.46 
 
 
393 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  45.91 
 
 
395 aa  321  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  42.54 
 
 
392 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  43.21 
 
 
393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  44.44 
 
 
393 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  43.53 
 
 
392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  43.28 
 
 
392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  45.66 
 
 
395 aa  320  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  47.9 
 
 
394 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  43.46 
 
 
393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  43.46 
 
 
393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  43.46 
 
 
393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  43.46 
 
 
393 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  43.45 
 
 
398 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  43.28 
 
 
392 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  43.53 
 
 
393 aa  319  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  43.95 
 
 
393 aa  319  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2722  acetyl-CoA acetyltransferase  41.9 
 
 
391 aa  318  7e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  42.39 
 
 
391 aa  318  7e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  45.05 
 
 
394 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  43.28 
 
 
393 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  46.4 
 
 
396 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  43.03 
 
 
392 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.19 
 
 
401 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  44.23 
 
 
393 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  44.2 
 
 
393 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  42.39 
 
 
391 aa  317  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2074  acetyl-CoA acetyltransferase  45.52 
 
 
393 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  42.14 
 
 
391 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  42.14 
 
 
391 aa  316  4e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  42.14 
 
 
391 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  42.14 
 
 
391 aa  316  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  42.14 
 
 
391 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  42.14 
 
 
391 aa  316  4e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2690  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.94 
 
 
400 aa  316  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0340832  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  43.03 
 
 
392 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.58 
 
 
400 aa  316  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  46.65 
 
 
402 aa  315  6e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3852  acetyl-CoA acetyltransferase  41.65 
 
 
391 aa  315  7e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647198  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1915  acetyl-CoA acetyltransferase  42.96 
 
 
393 aa  315  8e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0319596 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3780  acetyl-CoA acetyltransferase  42.14 
 
 
391 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>