More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2896 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1222  acetyl-CoA acetyltransferase  85.79 
 
 
404 aa  719    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0492457  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2896  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
404 aa  811    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0192  acetyl-CoA acetyltransferase  69.58 
 
 
402 aa  565  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6898  acetyl-CoA acetyltransferase  68.91 
 
 
398 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0124  acetyl-CoA acetyltransferase  69.33 
 
 
402 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0142  acetyl-CoA acetyltransferase  68.83 
 
 
402 aa  558  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.771451  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7332  acetyl-CoA acetyltransferase  64.93 
 
 
401 aa  522  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213335  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7151  acetyl-CoA acetyltransferase  55.1 
 
 
405 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1860  acetyl-CoA acetyltransferase  54.57 
 
 
402 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00028581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1802  acetyl-CoA acetyltransferase  53.5 
 
 
407 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4368  acetyl-CoA acetyltransferase  53.96 
 
 
405 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2726  acetyl-CoA acetyltransferase  54.07 
 
 
404 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1976  acetyl-CoA acetyltransferase  53.09 
 
 
405 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1739  acetyl-CoA acetyltransferase  53.09 
 
 
404 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126801  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1758  acetyl-CoA acetyltransferase  53.09 
 
 
404 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3929  acetyl-CoA acetyltransferase  55.8 
 
 
403 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.041846 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1805  acetyl-CoA acetyltransferase  53.09 
 
 
404 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3827  acetyl-CoA acetyltransferase  54.93 
 
 
403 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4166  acetyl-CoA acetyltransferase  53.71 
 
 
407 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1347  acetyl-CoA acetyltransferase  52.97 
 
 
403 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.901733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1524  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 
407 aa  348  7e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  47 
 
 
393 aa  324  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  47.12 
 
 
393 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  47.12 
 
 
393 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  46.75 
 
 
393 aa  322  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  47.12 
 
 
393 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  46.87 
 
 
393 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  46.87 
 
 
393 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  46.87 
 
 
393 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  46.87 
 
 
393 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  45.61 
 
 
393 aa  319  7e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  46.13 
 
 
393 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  46.62 
 
 
393 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  46.62 
 
 
393 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  46.25 
 
 
393 aa  316  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  46.37 
 
 
393 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  46.37 
 
 
393 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  46.37 
 
 
393 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  46.37 
 
 
393 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  46.37 
 
 
393 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  48.15 
 
 
402 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  46.12 
 
 
393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  44.47 
 
 
398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2280  acetyl-CoA acetyltransferases  45.13 
 
 
426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  45.89 
 
 
393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  44.42 
 
 
393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  46.12 
 
 
393 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  46.87 
 
 
393 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  44.2 
 
 
392 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1587  acetyl-CoA acetyltransferase  46.12 
 
 
393 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1915  acetyl-CoA acetyltransferase  45.86 
 
 
393 aa  309  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0319596 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  43.73 
 
 
398 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  46.12 
 
 
393 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  44.55 
 
 
393 aa  308  8e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  46.12 
 
 
393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  43.63 
 
 
399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  45.79 
 
 
392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  45.86 
 
 
393 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  44.33 
 
 
392 aa  306  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  44.55 
 
 
393 aa  306  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  43.63 
 
 
394 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.67 
 
 
400 aa  305  8.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.81 
 
 
401 aa  305  8.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.67 
 
 
400 aa  305  8.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  45.86 
 
 
393 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  45.5 
 
 
392 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2498  acetyl-CoA acetyltransferase  44.04 
 
 
389 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  46.04 
 
 
392 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  45.75 
 
 
392 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  45.5 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  45.57 
 
 
396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  43.35 
 
 
393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3718  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.06 
 
 
400 aa  303  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  45.86 
 
 
393 aa  303  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3299  acetyl-CoA acetyltransferase  46.42 
 
 
392 aa  302  7.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  45.5 
 
 
392 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  44.86 
 
 
392 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1508  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.31 
 
 
401 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  43.78 
 
 
401 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.08 
 
 
400 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  44.75 
 
 
392 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  43.32 
 
 
396 aa  298  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.87 
 
 
412 aa  298  1e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2804  acetyl-CoA acetyltransferase  44.61 
 
 
392 aa  298  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  hitchhiker  0.0000152049 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3063  acetyl-CoA acetyltransferase  42.36 
 
 
408 aa  297  3e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.18 
 
 
424 aa  297  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  43.92 
 
 
403 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  45.21 
 
 
402 aa  296  6e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5094  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.94 
 
 
400 aa  295  8e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0641  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.86 
 
 
390 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  43.42 
 
 
392 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  44.31 
 
 
393 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  45.68 
 
 
394 aa  294  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.06 
 
 
400 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  44.53 
 
 
402 aa  294  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  44.06 
 
 
393 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  43.7 
 
 
392 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0314  acetyl-CoA acetyltransferase  42.64 
 
 
400 aa  293  4e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0364767  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  44.83 
 
 
395 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.69 
 
 
406 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.232956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>