16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1195 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1195  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  756    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0092  hypothetical protein  26.6 
 
 		 242 aa  67  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  38.03 
 
 		 315 aa  53.5  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.25 
 
 		 749 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  40.58 
 
 		 444 aa  50.4  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  33.78 
 
 		 623 aa  49.3  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0215  putative amicyanin precursor protein  35.21 
 
 		 113 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4195  blue (type1) copper domain-containing protein  34.09 
 
 		 105 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0422303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  38.03 
 
 		 152 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  31.03 
 
 		 114 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  32.61 
 
 		 111 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  37.5 
 
 		 179 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  37.33 
 
 		 358 aa  43.9  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.5 
 
 		 417 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  35.71 
 
 		 114 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  32.63 
 
 		 144 aa  42.7  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>