26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0780 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0780  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  100 
 
 
273 aa  531  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0177  hydrolase  53.48 
 
 
266 aa  259  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4396  haloacid dehalogenase-like hydrolase, type 3  49.81 
 
 
265 aa  241  9e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5567  sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  35.66 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  28.03 
 
 
265 aa  55.5  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0762  Cof-like hydrolase  25.57 
 
 
277 aa  52  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1919  SPP-like hydrolase  25.21 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  22.27 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2939  SPP-like hydrolase  24.35 
 
 
232 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000389482  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  18.53 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2604  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  27.62 
 
 
312 aa  46.2  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  36.05 
 
 
272 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0497  protein cof  36.05 
 
 
272 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  36.05 
 
 
272 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0506  hypothetical protein  36.05 
 
 
272 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  0.663931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0516  protein cof  36.05 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.45 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  23.62 
 
 
285 aa  44.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  23.53 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0772  HAD family hydrolase YedP  24.21 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  20.65 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3291  Cof-like hydrolase  21.95 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6169  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  26.97 
 
 
271 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1623  putative sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  23.89 
 
 
247 aa  43.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0026077  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0866  SPP-like hydrolase  23.85 
 
 
228 aa  42.7  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0638  hypothetical protein  23.42 
 
 
226 aa  42.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>