17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0677 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0677  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  278  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2228  TadE family protein  43.38 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3425  TadE family protein  41.09 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0836  hypothetical protein  42.75 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0556219  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4450  hypothetical protein  38.78 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.283918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4964  hypothetical protein  40.15 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1229  hypothetical protein  40.32 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172727  hitchhiker  0.00916576 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1731  hypothetical protein  41.46 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000472333  normal  0.0606167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4038  hypothetical protein  44.83 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31046  normal  0.0267217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2588  hypothetical protein  41.54 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0661216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4136  TadE family protein  34.85 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4650  TadE family protein  37.1 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66939  normal  0.930826 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3328  hypothetical protein  37.8 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00365817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8594  hypothetical protein  38.02 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.433513  normal  0.881427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1547  hypothetical protein  32.84 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1366  hypothetical protein  41.56 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6888  hypothetical protein  36.9 
 
 		 141 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0908877  normal  0.53378 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>